生物素标记RNA探针制备实验流程:
1. 自行准备,带 T7 启动子序列的线性化探针模板质粒、PCR 产物或者合成的模板 DNA 片段。
2. 将试剂盒中各组分取出,BIOG T7 RNA Polymerase 、RNA Protector、Biolabelling Mix 置于 2-8℃冰箱解冻,其余成分放置于室温融化,各组份解冻后 3000rpm 离心 30 s。
3.按下表顺序依次加入反应组分:
*注意加样顺序,请预先计算好体积,严格按照以下顺序加入各反应组份:水→Buffer→Biolabel Mix→RNA Protector→DTT→酶→DNA模板,模板和酶一定要最后加入。
*模板加入量最好在 0.5-1μg 之间,如模板量确实较少,可低于 0.5μg。
4. 用移液器轻轻混匀各组分,并短暂离心收集,37℃孵育 2 h。如合成小于 0.2kb RNA,可将反应延长至 4 h。
5. 本试剂合成的 RNA 探针一般不需要再纯化,如需纯化,建议采用乙醇沉淀法进行纯化,具体操作可参考分子克隆等工具书。
6. 如欲检查 RNA 探针的标记效果,可按下表分别配制反应液,按本说明书上述方法分别进行 RNA 合成:
表 1 质控 DNA 模板未标记 RNA 合成
表 2 质控 DNA 模板标记 RNA 合成
反应结束后,分别取 1ul 反应液进行变性琼脂糖凝胶电泳(1.5%),如发现标记 RNA 的电泳条带略后于未标记 RNA,则表明标记成功。也可取2ul 标记 RNA,点样于带有正电荷的尼龙膜,进行斑点免疫检测,详见分子克隆等工具书。
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