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前言
在转录与蛋白合成之间,有一道重要的桥梁——翻译中的mRNA,即活跃翻译转录本。
如果您想判断某个基因是否真正被翻译?鉴定与核糖体结合的mRNA群体?挖掘潜在的翻译调控机制?
新使生物全新推出RNC-seq,满足您的科研需求!
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技术原理
RNC-seq(Ribosome-Nascent chain Complex RNA-seq)是以核糖体-新生肽链复合物(RNC)为对象,富集正在翻译的mRNA,随后进行RNA测序。
相比常规RNA-seq,它更直接反映翻译活性,是解析转录与翻译协调关系的重要工具。
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新使生物RNC-seq服务流程
1. 样本处理及质检
2. 超速离心富集RNC复合物
3. 提取结合RNC的RNA
4. 建库和测序
5. 生信分析
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新使生物技术优势
在RNC-seq项目中,样本富集方式直接决定了后续数据的分辨率和可信度。
目前常见2种富集核糖体-核酸复合物(RNC)方法:
A)树脂柱(MicroSpin S-400 HR)分离法:基于分子大小进行柱分离,对大分子复合物进行富集。
富集目标
特点
存在问题
大分子复合物(粗分离)
操作简便、成本低
分辨率有限,其他大分子会共流出导致背景高、过柱过程可能导致RNC解离,实验重复性低
B)Sucrose cushion蔗糖垫超速离心法:基于颗粒密度和沉降速率差异,通过高浓度蔗糖垫和超速离心,特异富集核糖体及其复合物。
富集目标
特点
存在问题
核糖体及其复合物(高纯度)
高纯度、高特异性、重复性较好
仪器成本高、操作繁琐、门槛较高
高于行业标准&严格遵循文献方法的RNC-seq富集:我们只选Sucrose Cushion蔗糖垫超速离心法!
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新使生物平台优势
1. 适用多物种:哺乳动物、植物、真菌
2. 适配多种细胞系与组织样本
3. 新使生物拥有完善的仪器设备和丰富的翻译组技术经验。
4. 翻译组技术服务全覆盖(见下文 08其他服务)
5. RNC-seq项目灵活选择RNA提取方式:
方案一:Poly(A)+富集建库,适合研究针对mRNA翻译活性的科研客户。
方案二:rRNA去除建库,适合研究lncRNA、circRNA翻译、病毒RNA翻译等非经典转录本。
详情点击图片参阅文章《翻译组RNC-seq | 两种建库方式,如何选择最适合你的研究方案?》
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交付内容
1. 原始测序数据(FASTQ)
2. 基因表达定量(TPM/FPKM)
3. 差异表达分析
4. 富集通路与GO分析
5. 可视化结果图(火山图、热图、TE散点图等)
6. 翻译效率分析(可选)
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应用场景举例
1. 肿瘤在药物干预下的翻译响应分析
2. 某转录因子敲除对下游mRNA翻译效率的影响
3. 逆境胁迫下生物翻译重编程机制研究
4. lncRNA潜在翻译能力的初筛与验证
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其他服务
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新使生物官方网站:www.neoribo.com
销售区域:中国大陆、亚太地区、美国
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