空间分析正以全新的视角揭示那些曾被忽视的生命奥秘--从细胞分布、微环境互作、关键调控机制到空间生物标志物。2025 年 8 月 26 日10x Genomics 空间峰会将于上海举办,本次会议主题开辟空间生物学新航道 • 遇见未知 探索新径》,特邀肿瘤学、免疫学和神经科学等多领域专家,分享前沿突破性成果,同时带来 10x Genomics 最新 Visium 与 Xenium 空间平台进展,助力空间生物学研究全面升级。

会议提供「线上直播」「线下参会」两种参会方式,诚邀您与研究者一起,共同探索空间技术如何引领生物学研究,突破研究边界!

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会议嘉宾及参会议程

亮点内容抢先看

前沿研究者将带来最新研究成果及重要发现,从食管癌进化图谱的绘制、三级淋巴结构对免疫应答的调控,到乳腺癌 ADC 药物疗效的预测,充分展示空间组学在解析复杂生命活动和精准医学研究中的重要作用和应用潜力。

曾博苏州系统医学研究所 研究员

1. Cancer Cell:利用空间转录组,绘制首个食管癌发生发展的单细胞多阶段空间进化图谱

癌症的发生发展涉及肿瘤细胞及其周围微环境的共同进化,然而目前对组织空间结构中它们相互作用的动态变化仍不清楚。2025 年 3 月 10 日,中国医学科学院联合团队在Cancer Cell发表重要研究 Single-cell multi-stage spatial evolutional map of esophageal carcinogenesis,研究者对 43 名患者的 127 个多阶段组织样本进行单细胞空间转录组分析,绘制出人类食管鳞状细胞癌(ESCC)的进化轨迹。通过 640 万个细胞分析,发现 ESCC 进展由一群增殖性上皮细胞亚群驱动,并驱动癌症相关成纤维细胞(CAFs)的招募和转化,最终形成 CAF-Epi(CAF 和上皮细胞)生态小室,促进肿瘤细胞免疫逃逸。为鳞状细胞癌治疗和患者预后评估提供关键靶点和指标。

讲座亮点:

(1)首次从单细胞、空间维度系统性揭示了人类食管鳞状细胞癌(ESCC)的进化轨迹

(2)揭示了 JAG1–NOTCH1 信号轴的空间激活模式,驱动 CAF–Epi 生态位的形成,以促进肿瘤免疫逃逸

(3)建立「CAF-Epi-Immune」评分体系,成功将机制发现转化为临床预测指标

孙云帆肝胆肿瘤与肝移植外科副主任医师、复旦大学附属中山医院

2. 整合多组学揭示长期生存者中三级淋巴结构选择压力下的癌症进化

研究基于多组学分析发现在 TLS 阳性肿瘤中,成熟型肿瘤内淋巴样结构(TLS)能够限制肿瘤基因组的进化,从而带来长期生存获益。TLS 内富集了一类静息态干样 CD8⁺ T 细胞,并为其提供支持性的肿瘤内微环境;此外,区域性的 IgM–FcμR 相互作用进一步增强了这类干样 CD8⁺ T 细胞的抗肿瘤免疫效应。

讲座亮点:

(1)多组学发现肿瘤内成熟型 TLS 限制肿瘤基因组进化,延长患者生存期

(2)静息态干样 CD8⁺ T 细胞亚群在 TLS 阳性肿瘤中显著富集

(3)TLS 为干样 CD8⁺ T 细胞提供支持性肿瘤内微环境

(4)空间组学揭示局部 IgM–FcμR 相互作用增强干样 CD8⁺ T 细胞的抗肿瘤免疫效应

马丁复旦大学附属肿瘤医院 副研究员

3. Cancer Cell:空间多组学结合 AI 模型,预测抗体偶联药物在乳腺癌辅助治疗中的效果

在癌症治疗中,为下一代抗体偶联药物 (ADC) 选择最佳候选药物仍然具有挑战性。2025 年 6 月 9 日,复旦大学研究团队在Cancer Cell发表最新研究成果Spatial determinants of antibody-drug conjugate SHR-A1811 efficacy in neoadjuvant treatment for HER2-positive breast cancer,研究利用基因测序、计算病理学和单细胞原位空间成像,在临床试验中确定抗体偶联药 SHR-A1811 治疗的 HER2 阳性乳腺癌患者的治疗生物标志物。同时开发了一种 AI 预测模型,根据临床特征和病理图像预测其对偶联药物的治疗反应性。

讲座亮点:

(1)基于空间成像,确定了对抗 HER2 抗体偶联药物(ADC)辅助治疗反应性的空间生物标志物

(2)结合 Xenium 技术与数字病理学揭示了这些空间生物标志物的作用机制

(3)基于空间生物标志物可实现乳腺癌的精准方案选择

俞章盛上海交通大学生命科学技术学院、上海交通大学医学院 教授

4. Nature Communication:HERGAST 揭示超大空间转录组切片中的精细空间结构并增强基因表达信号

空间转录组学(ST)技术彻底改变了我们对组织内基因表达组织的理解,为细胞异质性和组织结构提供了宝贵的见解。近年来,空间转录组学技术正向高分辨率平台过渡,如 Visium HD 和 Xenium。2025 年 4 月 28 日,上海交通大学研究团队在Nature Communication发表最新研究 Unveiling fine-scale spatial structures and amplifying gene expression signals in ultra-large ST slices with HERGAST,提出一种用于超大规模和超高分辨率空间转录组学数据中的空间结构识别和信号放大的系统 HERGAST,采用分割—迭代—征服(DIC)的分析计算架构,用于克服现有空间组学计算方法的局限性,有效处理超大型空间转录组学数据。为复杂空间组织和肿瘤异质性解析提供依据。

讲座亮点:

(1)分割–迭代–征服(DIC)框架实现了超大规模空间转录组数据的可扩展分析

(2)HERGAST 构建了结合空间与基因表达特征的异质图谱

(3)HERGAST 可从噪声较大的空间转录组数据中有效还原稀疏基因信号

而来自10x Genomics 专家将带来Visium 与 Xenium 平台的最新进展及未来规划,与大家探讨这些技术如何加速基础研究与药物研发的创新进程。

亮点提要:

1.Visium 平台最新进展:如 Visium HD 3’,Visium HD Cell Segmentation 以及 Visium 平台未来的研发计划

2.Xenium 平台最新进展:如 Xenium 高级定制 panel,Xenium RNA 及蛋白共检测解决方案以及 Xenium 平台未来的研发计划

3. 空间组学技术的最新应用以及空间组学技术如何加速药物研发

内容策划:邹礼平

内容审核:朱卿

题图来源:图虫创意