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真核细胞中蛋白质翻译的起始位点通常是由mRNA上的起始密码子AUG决定的,起始密码子的位置和优势性决定了蛋白质产物的种类和产量。如何在不改变基因序列的前提下,控制蛋白质翻译的起始是很有意义的,因为这不仅能达到内源性基因表达的可控性,还能提升外源性mRNA药物的翻译效率 。

2025年11月21日,美国康奈尔大学钱书兵教授领衔的科研团队在Nature Biotechnology上发表了题为Programmable initiation of mRNA translation by trans-RNA的研究论文,开发了新型RNA技术。这项蛋白质翻译起始的重编程技术通过控制核糖体在mRNA上的移动来选择特定的起始密码子,从而影响蛋白质产物的质和量。

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在此项研究中,研究团队首先设计了靶向mRNA报告基因的小RNA,其特点是具有帽子结构并且和靶向mRNA碱基互补配对。在不影响mRNA稳定性的前提下,这种小RNA分子在细胞内显著提升了蛋白质合成水平。在分子机制上,这些互补的小RNA分子通过5帽子结构直接招募核糖体至mRNA上特定的起始密码子。与此同时,还吸引更多的核糖体至靶向mRNA的5’帽子结构上,形成促进翻译的协同效应。研究人员将这种互补的小RNA分子命名为trans-RNA。

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有意思的是,trans-RNA不仅能作用于线性mRNA,还能用于环状RNA。 环状RNA的翻译过程通常依赖内部核糖体进入位点(IRES)。trans-RNA可以驱动不带有IRES的环状RNA进行蛋白质翻译。除此之外,还与IRES具有功能协同作用,从而从另一维度增强环状RNA的翻译起始效率,进一步推动其药理学应用场景。

trans-RNA 的功能更体现在单一mRNA上多重翻译起始位点的可控性。通过设计靶向特定起始密码子的trans-RNA,可模拟应激状态下ATF4的表达上调效应。此外还能选择性调控C/EBPβ截短体与全长蛋白的表达,进而介导脂肪分化和沉积等生物学效应。这些实验都在小鼠模型上得到验证。

最后,研究团队发现trans-RNA天然存在细胞内,可能代表着一种具有翻译调控功能的小RNA分子。通过建立全新的带帽小RNA测序方法,研究团队鉴定出trans-RNA在细胞内的分布特征,发现其主要富集于mRNA起始密码子附近区域,这一特征与其预期的翻译调控功能相吻合。

康奈尔大学博士后贾龙飞为本文的第一作者,目前已入职南京医科大学。除了康奈尔大学钱书兵课题组、法国的Yaser Hashem团队为论文贡献了单颗粒冷冻电镜技术,他们为共同通讯作者。

https://www.nature.com/articles/s41587-025-02897-1

制版人: 十一

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