早在上世纪80年代,AI技术就已经开始用于创新药研发流程,但是由于技术条件的限制,长期以来停留在辅助性工具的层面。
进入到2025年,随着AI技术的突飞猛进,拐点悄然出现。
以大模型、生成式算法等为代表的新一代AI技术,不再只是锦上添花式的辅助工具,而是逐渐走向舞台中央,成为有望重塑创新药产业的关键变量。
作为全球AI产业绝对龙头的英伟达,也敏锐地捕捉到了这一趋势。
在英伟达的寄予厚望的NVIDIA Inception计划中,首批合作的五家亚太地区AI公司,其中一家就是专注于新药发现赛道的南洋生物(Nanyang Biologics )。
这是一家位于新加坡,以前沿AI技术结合稀缺的天然化合物资源库,在AI新药发现领域走出了一条高度差异化道路的新锐公司,并且已经启动了登陆资本市场的流程。
2025年10月,南洋生物已与一家已上市的特殊目的收购公司RFAI签订业务合并协议,目的是通过该项交易使南洋生物成为上市公司,其预期市值超过15亿美元。
交易完成后,合并公司预计将以南洋生物的英文缩写“NYB”作为代码,于纳斯达克上市。
这将是南洋生物这家AI时代的“创新药梦工厂”,走向全球的一个崭新起点。
全球稀缺的天然化合物分子库
目前为止,在全球范围内的AI新药发现,主要还是围绕着大规模的合成/虚拟化合物库进行。
以AI驱动的针对天然化合物的新药发现,正在成为上述传统路线之外的一个充满希望的新兴方向。
这也是南洋生物正在发力的一个前沿赛道。
在与南洋理工大学Li Hoi Yeung副教授的深度合作之下,南洋生物已经打造了一个以5万余种热带生物为基础的天然化合物分子库,其中包含超过100万个结构多样的天然化合物分子,被行业称为“全球最大、最多样化的天然药物库之一”。
这个天然化合物分子库,是一个具有高度稀缺性的底层资产。
随着AI技术的出现,基于天然化合物的新药发现,相比于传统路线具备显著的优势。
一方面,要找到一个能与体内靶点互相作用、且能产生治疗效果的小分子化合物,本身就是一件小概率事件,但是天然化合物具备天然的更高胜率。
相比于合成化合物,天然化合物经历了漫长的进化筛选,天生就是为了和蛋白质等生物大分子发生特异性的相互作用。
在高通量筛选中,天然分子库的命中率往往高于同规模的纯合成分子库。
另一方面,新药研发的效率和成功率得到了实质性提升。
天然化合物在化学多样性、靶点作用能力均显著优于规则相对单一的合成化合物,因此成药性更高。
如果加上前沿AI技术的高效筛选,可以将新药发现的效率提高1000倍以上。
有研究显示,天然化合物来源的新药,在临床试验阶段的成功率,也明显高于纯合成小分子。
同时,对于难成药靶点,天然化合物也具备独特优势。
由于更复杂的空间立体结构以及更特异性的界面匹配能力,天然化合物具有更好的结合难成药靶点的潜力,具有更高的攻克难成药靶点的概率。
从底层资源的角度而言,南洋生物坐拥这样一座全球稀缺的天然化合物的宝库,奠定了其差异化的新药发现路线的基础,在某种程度上可以说是已经赢在了起跑线。
全球头部的AI新药发现平台
全球稀缺的天然化合物分子库,是南洋生物成为全球“创新药梦工厂”的必要条件,而这家公司已经建成的AI新药发现平台,则为梦想的实现提供了充分条件。
DTIGN是南洋生物与南洋理工大学联合开发的“药物-靶点相互作用图神经网络”,它把图神经网络、自注意力、蛋白语言模型和半监督学习整合进一个多模态框架,专门用来预测化合物分子与靶点之间的相互作用和生物活性,可以说是公司AI驱动的新药发现平台的“核心引擎”。
这套AI新药发现系统的一大特点,是用图神经网络直接建模“药物-靶点复合物”,本质上是把小分子和蛋白口袋当成一个整体系统来建模,这种模型直接面向真实的三维物理交互作用,天然更接近药物作用机理,同时也为后续的分子优化和生成设计提供更可解释的作用位点指引。
目前,南洋生物基于DTIGN的新药发现平台,已经展现出远超业界平均水平的优异性能。
一方面,是新药发现的“命中率”显著提高。
一篇公开发表的论文显示,在蛋白-配体复合物基准数据集上,DTIGN相比9种主流的深度学习方法,对生物活性预测的平均性能提升约27.03%。
另一方面,新药发现的效率也获得巨大的提升。
根据南洋生物的官网信息,基于DTIGN的药物发现流程,相比传统方法可把新药发现周期缩短最多68%。
在实际项目中,早期版本的DTIGN在单台AI服务器上,曾经在6个月内帮助一家日本药企成功筛出15个候选分子。
基于这种优异的AI新药发现能力,南洋生物获得了市场和同行的广泛认可。
目前,南洋生物已经与全球AI产业的领导者英伟达、慧与科技(HPE)、Equinix及其他顶尖研究机构,展开深刻的战略合作,共同打造AI新药发现的完善生态系统。
2025年8,在新加坡举办AI4LifeSummit2025活动中,南洋生物现场与NVIDI等多家公司署合作备忘录,共同建设全球最大天然化合物库、开发可扩展的AI药物发现平台。
强劲的在研管线
相比于很多AI新药发现公司长时间停留在概念阶段,南洋生物已经在短时间内,产出了一批有潜力的创新药候选分子,初步验证了“天然化合物库+AI新药发现”的强大效力。
其中,最为外界关注的管线,是一款源自热带天然化合物、由DTIGN平台筛选出来的靶向ILF2的小分子NB-A002。
ILF2是一种RNA结合蛋白,参与RNA剪接、DNA损伤应答以及同源重组修复等过程,该靶点目前也是行业重点关注的新型抗肿瘤靶点之一。
由于缺乏可成药的酶活性口袋,同时界面平坦、部分无序,传统小分子难以获得足够选择性,ILF2靶点是一个典型的难成药靶点,迄今为止尚无靶向ILF2的创新药管线进入临床试验阶段。
目前,南洋生物的NB-A002,已取得成功的临床前结果,在治疗卵巢癌、乳癌、肺癌及其他实体肿瘤上展现出极高的潜在价值,有望成为攻克ILF2靶点的潜在管线。
NB-A002这款分子的成功筛选,充分验证了基于天然化合物多样性基础上的AI新药发现,针对难成药靶点的巨大优势。
除了NB-A002以外,南洋生物目前已经成功筛选出多款天然小分子候选药物,已经构筑了一个强劲的在研产品管线。
在已有的天然化合物库中构建高效的AI筛选能力,只是南洋生物的AI新药发现平台的第一步。
让AI系统不仅仅做筛选,而是做发现,根据研发需求设计创新药分子,这是南洋生物的下一步AI能力建设的目标。
未来,南洋生物计划利用生成式人工智能模型,设计具有潜在生物活性的新型天然类似物,在保持规模增长的同时,提升化合物库的多样性和功能丰富度。
走向全球的“创新药梦工厂”
作为真正具备差异化优势的AI驱动的药物探索平台,南洋生物有能力针对来自多个领域、庞大且未被满足的医疗需求,以高效的方式提供合适的解决方案。
未来,南洋生物将通过将管线BD给大型跨国药企等多种方式,将这种AI驱动的、具备显著差异化的创新能力,转化为可观的商业价值,成为全球范围的“创新药梦工厂”。
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