Illumina公司在旧金山JPM医疗会议上首次发布了名为"十亿细胞图谱"(Billion Cell Atlas)的基因组改变数据库,该工具可用于识别和验证药物靶点,并训练用于药物发现的AI模型。
这一疾病生物学工具的首个版本目前包含1.5亿个细胞的序列数据,计划在三年内扩展至50亿个细胞。阿斯利康、默沙东和礼来等制药集团已与Illumina建立合作伙伴关系,共同开发这一资源。
据这家基因测序专家介绍,该图谱已经是世界上最大的全基因组遗传扰动数据集。它利用CRISPR技术在250种疾病相关的人类细胞类型中开启和关闭20000个基因,构建健康和疾病状态下的生物活性图谱。
该项目选择的细胞系包括历史上难以解码的细胞,涉及心血管代谢疾病、神经系统疾病、免疫紊乱、罕见遗传疾病和癌症等领域。
此次发布对Illumina来说是一个关键时刻,标志着公司从传统的DNA下一代测序(NGS)领域向更广阔的方向拓展。这一举措建立在该公司最近成立的BioInsight业务部门基础之上,该部门致力于为生命科学研究开发数据资产、软件和AI技术,并扩大制药公司对多组学数据的访问。
BioInsight的核心任务是与行业合作伙伴开展大规模遗传和生物数据生成项目,而这个图谱正是该倡议的首个成果。
Illumina首席执行官Jacob Thaysen表示:"我们相信细胞图谱是一个关键发展,将使我们能够显著扩展AI在药物发现中的应用规模。我们正在构建一个无与伦比的资源,用于训练下一代精准医学和药物靶点识别AI模型,最终帮助绘制一些世界上最具毁灭性疾病背后的生物学通路。"
在JPM会议上,Thaysen表示Illumina的未来在于从三个领域寻求增长:测序、多组学,以及通过BioInsight将服务扩展到药物发现和临床转化的数据和软件领域。在经历了因测序市场成熟和竞争加剧导致的数年收入下降后,该公司在2025年重新恢复增长。
默沙东(在美国和加拿大称为Merck & Co)已开始在其药物发现业务中使用该图谱,例如训练其AI基础模型和构建可用于疾病研究的"虚拟细胞"。
合作伙伴表示,这项技术将向更多公司开放,能够帮助用户表征药物和疾病的作用机制,探索治疗药物的潜在新适应症,并验证来自人类遗传学的候选靶点。
"我们正在建立一座可扩展的桥梁,连接基因组洞察与治疗影响,加速从发现到临床的路径,并以前所未有的信心和速度实现对复杂疾病生物学的更深入理解。"
Q&A
Q1:十亿细胞图谱是什么?有什么作用?
A:十亿细胞图谱是Illumina公司发布的基因组改变数据库,目前包含1.5亿个细胞的序列数据,计划扩展至50亿个细胞。它可用于识别和验证药物靶点,训练用于药物发现的AI模型,是目前世界上最大的全基因组遗传扰动数据集。
Q2:十亿细胞图谱如何工作?
A:该图谱利用CRISPR技术在250种疾病相关的人类细胞类型中开启和关闭20000个基因,构建健康和疾病状态下的生物活性图谱。涉及的细胞类型包括心血管代谢疾病、神经系统疾病、免疫紊乱、罕见遗传疾病和癌症等难以解码的细胞。
Q3:哪些公司正在使用十亿细胞图谱?
A:目前阿斯利康、默沙东和礼来等制药集团已与Illumina建立合作伙伴关系。默沙东已开始在药物发现业务中使用该图谱,用于训练AI基础模型和构建"虚拟细胞"进行疾病研究,该技术还将向更多公司开放。
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