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新春传捷报!北京时间2026年2月19日,国际顶级学术期刊nature同期发表了上海交通大学医学院附属新华医院,以及松江研究院、附属新华医院联合其他单位的两项重磅研究成果,分别在罕见病ai诊断、神经发育疾病基因治疗领域实现世界性突破。

两项成果同日登国际顶刊,是上海交通大学医学院和附属医院坚持医教研协同发展、深耕前沿交叉领域的重要成果,以科技创新赋能临床诊疗、守护人民健康的生动实践,也是坚持“四个面向”,强化“有组织的科研”,不断提升科技创新能力的实力彰显。

孙锟教授团队联合发布:全球首创可溯源ai系统,破解罕见病诊断世界性难题

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由上海交通大学医学院附属新华医院孙锟教授、余永国教授与上海交通大学人工智能学院、医学人工智能研究院张娅教授、上海交通大学人工智能学院谢伟迪副教授领衔的联合团队,以临床问题为导向、联合研究为核心、技术落地为支撑,完成了从临床需求到技术突破、再到临床应用的全链条创新,研发出全球首个可溯源智能体式罕见病诊断系统deeprare,首创“中枢-分身”可溯源agentic ai架构,让ai诊断从“黑盒”变为“透明诊室”,彻底破解传统医疗ai推理过程不可追溯的“信任危机”。

该架构从三大维度实现对传统医疗ai的代际超越:知识储备上打破医学数据孤岛,深度整合并内化海量医学文献知识库与真实临床病例数据;诊断思维上跳出“模式匹配快思考”,拥有人类医生的“慢思考”能力,通过“假设-验证-自我反思”迭代循环推敲诊断线索;推理过程上实现全流程白盒推理,每一个结论均附带完整证据链条。硬核实测数据显示,deeprare诊断精度刷新世界纪录,仅依靠临床表型信息时,首位诊断准确率达57.18%,较此前国际最佳模型提升23.79个百分点,为缺乏基因检测条件的基层医院打造了罕见病快速筛查的“金钥匙”;引入基因测序数据后,复杂病例综合首位诊断准确率突破70.6%,显著优于国际通用的exomiser工具,其推理报告更获新华医院专家团队95.4%的高度认可。

目前,deeprare罕见病在线诊断平台已上线半年,吸引超1000名专业用户注册,服务全球600余家顶尖医疗科研机构;该系统已在新华医院完成院内部署并进入内测阶段,即将作为“数字质控员”应用于全院罕见病诊疗质控流程。孙锟教授透露,团队更正积极筹备发起“全球ai罕见病诊疗联盟”,同步启动“万人临床验证计划”,计划完成20000例疑难罕见病真实世界验证,让中国ai诊断方案惠及全球患者。

值得一提的是,在nature上线该论文的同期,期刊还特别邀请了澳大利亚西澳大学儿童健康研究中心专家timo lassmann撰写并配发了题为《ai成功诊断罕见病》(ai succeeds in diagnosing rare diseases)的“新闻与观点”(news & views)专文评论 。文章对deeprare给予了极高评价。lassmann在文中指出,deeprare这种多模块协同的架构,完美映射了罕见病专科中心多学科团队(mdt)的会诊模式,但其“运行的速度和规模却是人类团队无法企及的”。针对该系统的白盒化特征,文章给出了核心定调:“该系统可溯源的推理能力,可能是其走向未来临床应用最卓著的贡献。”评论强调,在面临重大医疗决策时,相比于给出“黑盒”答案,像deeprare这样“能够展示其推演过程的系统,才能经得起人类专家的审查并赢得信任,最终证明其更具实用价值。”

上海交通大学人工智能学院博士研究生赵唯珂、助理教授吴超逸博士、医学院附属新华医院副研究员范燕洁博士为论文的共同第一作者,人工智能学院张娅教授,谢伟迪副教授与医学院附属新华医院孙锟教授、余永国教授为论文的通讯作者。上海交通大学人工智能学院博士研究生邱芃铖、哈佛大学博士后张小嫚博士、上海交通大学本科生孙瑜泽、上海人工智能实验室博士后周晓博士、中南大学湘雅医学院附属儿童医院张树菊博士和彭聿博士、上海交通大学人工智能学院执行院长王延峰教授、医学院附属新华医院孙新教授对研究给予了指导、合作和支持。该项目得到了科技创新2030—“新一代人工智能”重大项目、上海市科学智能“百团百项”专项、上海市科委人工智能科技支撑专项项目支持。

仇子龙教授、李斐教授团队联合发布:脑内精准基因编辑,为神经发育疾病治疗点亮曙光

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上海交通大学医学院松江研究院仇子龙教授,上海交通大学医学院附属新华医院李斐教授、杨侃副研究员团队联合复旦大学脑科学转化研究院程田林研究员团队和中国科学院分子细胞科学卓越创新中心李劲松院士团队,聚焦由chd3基因突变导致的snijders blok–campeau综合征(snibcps)这一典型神经发育性疾病,实现了脑内基因位点的精准“修错”,为自闭症等神经发育疾病的基因治疗带来突破性进展。

研究团队首先针对chd3-r1025w热点高频突变,构建了复刻患者核心症状的人源化突变小鼠模型,为治疗研究搭建精准的“疾病模拟平台”;并创新性设计新型腺嘌呤碱基编辑器teabe,这款“基因工匠”可精准识别并将突变的a・t碱基对修复为正常的g・c碱基对,与传统技术相比,全程无dna双链断裂风险,大幅降低基因组紊乱风险。经细胞水平多轮筛选,团队锁定了编辑效率最高、脱靶效应最低的sgrna与编辑器组合,通过尾静脉注射将其送入突变小鼠体内后,编辑器成功抵达小鼠多个脑区实现靶向修复,且旁观者效应极低。随着小鼠体内chd3蛋白水平显著恢复,其社交回避、认知迟钝、运动不协调等行为异常得到显著改善,在三箱社交、新物体识别、巴恩斯迷宫等实验中均恢复正常表现。

为筑牢临床转化的安全防线,团队通过guide-seq技术全基因组排查脱靶位点,结果显示人类细胞中潜在脱靶位点编辑率均低于1%,小鼠脑中该数值更低;同时对次要突变开展功能验证,确认其不影响chd3蛋白正常功能。更重要的是,团队在非人灵长类(猕猴)模型中开展鞘内注射aav9-teabe实验,成功检测到明确的碱基编辑活性,验证了该技术的跨物种应用可行性,为后续临床试验积累了充足前期数据。

新华医院团队深耕儿童神经发育障碍领域二十余年,致力于其遗传及环境病因的基础到临床转化研究。李斐教授团队聚焦基因精准编辑在《nature》发表重磅成果的同时,还在环境病因研究方面有所突破,近期牵头完成的“神经发育障碍的生命早期环境风险因素识别和防控体系建立与推广”项目,在2025年中华医学科技奖评选中获医学科学技术奖一等奖。围绕儿童神经发育障碍领域的系列丰硕成果,将为该病的精准治疗开辟新路径。

上海交通大学医学院附属新华医院杨侃副研究员、复旦大学脑科学转化研究院博士后李维克、上海交通大学医学院松江研究院博士研究生耿一啸、山东大学齐鲁医院小儿内科博士后张淑倩、中国科学院分子细胞科学卓越中心博士研究生程艳波、云南大学医学院吴诗昊副研究员为论文的共同第一作者,上海交通大学医学院附属新华医院杨侃副研究员、李斐教授、复旦大学脑科学转化研究院程田林研究员、上海交通大学医学院松江研究院仇子龙教授为论文的共同通讯作者。中国科学院分子细胞科学卓越中心李劲松院士团队与上海交通大学医学院附属松江医院都爱莲主任团队对研究给予了指导与大力支持。本研究得到了国家科技重大专项,国家自然科学基金、科技部科技创新2030-“脑科学与类脑研究”重大项目、上海市科学技术委员会、上海市高水平地方高校创新团队、上海市卫生健康委员会、中科院青年创新促进会、上海交通大学医学院附属新华医院“学科攀峰计划”等资助。

近年来,上海交通大学医学院坚持“四个面向”,围绕医学重大热点和难点问题,强化“有组织的科研”,不断提升科技创新能力、完善科研组织模式、建立成果转化体系,构建完善科研效能提升架构,产生了大量具有影响力的科研成果,为医学科技进步注入了强劲动能。

未来,上海交通大学医学院和附属医院将锚定国家战略新需求,深化创新评价“新激励”,打造创新策源“强引擎”,勇闯科研创新“无人区”,系统推进科技创新和成果转化的高质量发展,为建设中国特色世界一流医学院和一流医学学科、服务国家高水平科技自立自强贡献源源不断的“交医”力量。

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编辑:陈露

资料:上海交通大学医学院

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上观号作者:上海杨浦