1. qPCR
前提:你已经提前锁定目标基因(有明确候选)
作用:精准验证少数基因的表达变化,通量极低
适用场景:已知通路 / 已知靶点,只需要确认几个基因是否改变。
2. RNA-seq
前提:没有候选基因,完全不知道哪些基因会变化
作用:无偏向全基因组扫描,一次性测出全部转录本,挖掘未知新基因、新通路
适用场景:机制初探、造模 / 给药后全局转录变化筛查
3. 正确流程: RNA-seq 全局筛选 → qPCR 挑选关键基因验证 绝大多数情况测序后都要挑基因做 qPCR 核验,让结果更可靠。 反向先 qPCR 再 RNA-seq 仅适合补充深挖,不属于标准实验设计,会浪费测序成本。
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