科研经费博士研究生专项计划，是全日制学习模式，但部分学校不安排住宿。经费来源分为导师课题组出资、学生自费或双方分摊三种，费用因学校和专业不同在十几到三十万不等，常被称为自费博士。
这类博士通常没有常规奖助学金，但部分学校允许参评国家奖学金和其他校级及社会类奖助学金。
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青岛大学2025年的科研博士与普通计划博士培养标准一致，学费、修业年限、学籍管理等完全相同，报考类别为定向，报名时间为2025年5月13日13:00至5月18日24:00。
大湾区大学与中山大学2026年联合培养的博士属于科研经费型，计划招收约40名，课程学习在中山大学，论文研究结合大湾区大学的科研任务，课程阶段由中山大学提供住宿，其他阶段由大湾区大学在东莞提供住宿，学制4年，毕业颁发中山大学的学位和毕业证书，大湾区大学发放科研津贴。
南方医科大学2025年科研经费博士专项拟招收49人，其中学术学位30名，专业学位19名，要求申请者英语水平达到CET-6≥425或IELTS≥6等标准，报名时间为5月17日10:00至5月23日17:00，考核包括资格审核、材料审查和综合考核。
大连海事大学2023年科研经费博士专项拟录取25人，公示期为10个工作日。后续985大学的自费博士数量可能会越来越多。
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