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西湖大学张垲课题组
课题组和项目简介
张垲博士于2018年获加州大学圣地亚哥分校（UCSD）生物信息学博士学位，2019–2023年在UCSD任兵教授课题组从事博士后研究，长期致力于基因转录调控网络研究，取得了一系列原创性成果，以第一作者在 Cell、Nature Methods、Nature Immunology、Nature Communications、Science Advances 等顶级期刊发表多篇论文。课题组已在单细胞表观遗传学领域积累了深厚的前期成果，自主开发了SnapATAC2（Nature Methods，2024）、Precellar （https://github.com/regulatory-genomics/precellar）等一系列高效、可扩展的单细胞多组学分析工具，并在全球范围内被广泛引用和应用；同时构建了海量高质量单细胞与表观遗传多模态数据资源库 （Cell，2021），为大模型训练、调控网络解析和疾病机制研究提供了坚实的数据和技术基础。 课题组目前聚焦基因转录调控机制，综合运用计算生物学、机器学习与多组学整合分析等跨学科手段，系统解析细胞分化、衰老及重大疾病的表观遗传调控网络。
因科研发展需要，现面向海内外公开招聘 博士后、助理研究员及科研助理若干名，主要参与以下项目：
1. 基因组学大模型构建与优化：整合海量单细胞与表观遗传等多模态基因组数据，开发面向生命科学的预训练基础大模型（Foundation Models）。通过底层算法创新，提升模型对顺式调控元件的精准识别能力，并实现从 DNA 序列到基因组功能及表型的跨维度预测。
2. 基于 AI Agent 的单细胞多组学智能解析生态构建：引入前沿的大语言模型（LLM）与多智能体（Multi-Agent）协同技术，构建开放、动态的分析计算生态。开发具备自主规划、工具调用与交互推理能力的 Agent 网络，打通从数据清洗到机制解析的“端到端”闭环。
3. 肾脏疾病时空多组学解析与分子病理诊断模型构建（临床合作）：联合北京协和医院肾内科陈丽萌教授顶尖临床团队，以高质量临床队列为依托，综合运用单细胞多组学（scRNA-seq + scATAC-seq）及空间转录组技术，解析肾脏疾病细胞类型特异性的致病网络，构建新型分子病理诊断 AI 模型。
课题组网站：https://lab.kaizhang.org
工作地点：杭州市西湖大学云栖校区
联系人：张垲研究员
招聘岗位及要求
博士后/助理研究员（常年招聘）
岗位职责：
1.独立或合作开展课题研究；
2.协助培养学生及科研助理；
3.撰写研究论文、综述；
4.独立或合作撰写基金项目申请以及参与学术交流
应聘条件：
1.已取得或即将取得计算生物学、生物信息学、人工智能、统计学、基因组学或相关专业博士学位；
2.有单细胞组学或表观基因组学研究经验者优先；
3.以主要作者身份发表过较高水平论文，具备良好的英文科研论文写作与学术交流能力；
4.具有强烈的科研内驱力与团队协作精神。
科研助理（常年招聘）
岗位职责：
1.数据收集与管理：整理生物样本相关信息、数据预处理、建立和维护数据库；
2.使用生物信息相关软件与工具进行数据分析、统计分析和可视化；
3.协助实验室成员完成科研项目，或根据个人兴趣可自主承担课题项目。
应聘条件：
1.本科及以上学历，生物信息学、计算机科学、统计学或相关专业背景；
2.具备较强的数据处理、编程与可视化能力，能独立承担课题数据分析和流程开发任务；
3.工作严谨细致，责任心强，能适应快节奏的科研环境。
薪资福利及发展支持
1.与顶尖科研创新团队共事，提供充足的科研经费、高性能计算集群资源及国内外学术会议交流支持；
2.提供具有竞争力的薪酬待遇，博士后按国家及依托单位标准执行，表现优异者可优先推荐申报各类人才项目，优秀博士后出站可留校聘为助理研究员；助理研究员/科研助理待遇面议
3.提供完善的社会保险、住房公积金、补充医疗保险、教职工年度体检等福利，加入工会后可享受工会会员福利，如节日及生日福利、教职工疗休养、参报医疗互助等；
4.可享受杭州市博士后生活补贴（24或29万元/两年），可申请认定杭州市高层次人才，符合条件者可申请应届生生活补贴（博士10万元）、应届生租房补贴（不超过3万元）、博士后出站留来杭补助（40万元）
5.可享受杭州市博士后科研资助（10万元），对获得中国博士后科学基金资助和浙江省博士后择优项目资助的，杭州市给予1:1配套资助；
6.协助博士后申请国家自然科学基金青年项目、中国博士后科学基金及省部级人才计划；
7.课题组注重成员职业发展，全力支持优秀博士后出站后申请国内外高校教职或顶尖生物医药/AI企业研发岗位。
申请方式
请将以下材料合并为单个PDF文件，按照以下任一方式发送至邮箱，应聘材料主题注明：“应聘岗位-姓名-毕业院校/当前单位”
1. 详细个人简历;
2. 研究计划或未来职业规划（1页，博士后/助理研究员申请者需提供）；
3. 2–3位推荐人姓名及联系方式（博士后/助理研究员申请者需提供）。
本招聘长期有效，招满即止。材料初审合格者，课题组将尽快安排线上/线下面试。所有申请信息严格保密。
投递简历请选择：西湖大学张垲课题组
简历投递方式（可选任一）：
1. 扫描二维码投递简历；
3. 点击链接投递简历：https://data.bioart.com.cn/f/p0EB2y（复制链接至浏览器投递简历）
课题组代表论文（* 表示共同第一作者）
1. Zhang, K., Zemke N.R., Armand E.J., Ren, B. A fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data. Nature Methods (2024)
2. Zhang, K.*, Hocker, J. D.*, Miller, M., Hou, X., Chiou, J., Poirion, O. B., ... Ren, B. A single-cell atlas of chromatin accessibility in the human genome. Cell (2021)
3. Zhang, K., Wang, M., Zhao, Y., & Wang, W. Taiji: System-level identification of key transcription factors reveals transcriptional waves in mouse embryonic development. Science Advances (2019)
4. Yu, B.*, Zhang, K.*, Milner, J., Toma, C., Chen, R., Scott-Browne, J., ... Goldrath, A. Epigenetic landscapes reveal transcription factors that regulate CD8+ T cell differentiation. Nature Immunology (2017)
5. Zhang, K., Li, N., Ainsworth, R., & Wang, W. Systematic identification of protein combinations mediating chromatin looping. Nature Communications (2016)
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制版人：半夏
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