一九四六年五月三日，东京开始审判日本战犯，这是人类第一次通过国际法庭的方式系统追究军国主义的罪行，中国检察官带去一百多份证据，其中一份是一九三七年十二月十八日《纽约时报》的头版内容，上面写着“南京大屠杀”，那是西方媒体首次使用这个词公开报道南京发生的事。

松井石根是攻打南京时的最高指挥官，他在法庭上说自己的行为是在管教中国兄弟，这种说法听起来很荒唐，居然真有人相信，他没有否认杀人放火的事，只是把侵略说成家务事，检方拿出了教会医院的记录、幸存者的讲述、日本军官的日记和照片视频等证据，把这些事情一一对应起来，最后法庭判定他犯下指挥责任罪，成为甲级战犯，原因是他没有阻止手下胡作非为。

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东京审判不仅判决了个人责任，还确立了新的国际法原则，将反和平罪与反人道罪作为独立罪名，后来的国际司法机构都沿用了这一先例，但日本国内部分政界人士和右翼团体至今仍拒绝承认审判结果，声称这是战胜国主导的裁决，同时在日本教科书中，对南京大屠杀等历史事件的记载也日趋简略模糊。

2025年NHK播出一部纪录片叫《东京审判未公开档案》，里面展示了日本外务省的秘密电报，证明政府高层早就知道南京发生的事但没有阻止，纪录片播出后右翼人士立即出来批评，但东京大学和早稻田的学生自己组织放映活动，现场观众里有一半是00后的年轻人，他们说学校课本里根本没提到这些内容。

中国国家档案馆在2024年更新了幸存者影像库，第六期增加了2300多小时的录像资料，其中一位98岁的老人面对镜头回忆道，那些人口中喊着兄弟，手里的刺刀却割开了他哥哥的喉咙。

现在东京那个法庭早就没人去了，但当年留下的材料还在被不同的人反复翻看，有人想抹掉这些痕迹，有人却努力记住它们。