系列简介
这是我们一系列原创技术贴,从易到难,每天学习一点。所有内容均为疾控数据分析、科研论文相关,或者说很多和现在的热门监测预警相关,所以我们这个系列就叫“监测预警基础”。
今天是第40节,从今天开始连续大概11讲的内容,我们细化,短篇化,彻底把ARIMA模型搞懂。
也许你听过不会用,也许你只是会跑结果不懂理论,或者也许你根本没听过也没用过,都没关系,我们这次就彻底学透ARIMA!
做传染病监测预警、公共卫生数据分析的同行,一定对「ARIMA」这个名字不陌生:
看核心期刊里的传染病预测研究,十篇有八篇都用它;写职称论文想做趋势分析,第一个被推荐的模型就是它;单位做年度流行趋势研判,也常能听到这个术语。
这应该是我们最熟悉的一个预测模型,也是最实用的一个!
但是很多小伙伴其实只是听过,或者有些听过没用过,或者有些只是会用户但不懂核心理论逻辑。
翻开教材想学,满页的公式和统计术语直接劝退;跟着网上的代码复制粘贴,改个自己的监测数据就报错;甚至连「为什么要差分」「残差是哪来的」都搞不明白。
这正是我们做《这一次一定学透 ARIMA》系列的初衷:全程用疾控人熟悉的传染病监测场景讲原理,避开复杂的数学推导,配套可直接复制的 R 代码,从基础概念到实战落地,一篇解决一个核心问题,跟着走完就能把 ARIMA 真正用到工作里。
以后你就也会做预测预警了,至少完成领导交代的任务问题不大!、
因为ARIMA 是最适配传染病监测场景的基础预测模型,几乎所有一线监测、预警、科研工作都能用上。
场景 1:传染病短期发病趋势预判,提前部署防控资源
流感、手足口、诺如、登革热这些有季节性规律的传染病,防控的核心是「提前预判」:
流感季什么时候会迎来高峰?高峰周的 ILI(流感样病例)大概会到多少?要不要提前发布健康提示、扩容发热门诊?
手足口流行季,下个月的病例数会不会超过往年同期?需不需要提前部署托幼机构防控?
ARIMA 最核心的能力,就是基于历史时间序列数据做短期预测。只要你有 3-5 年的周度 / 月度监测数据,就能用它拟合出流行规律,预测未来 1-4 周的发病趋势,给防控决策提供量化依据,而不是只靠经验判断。
场景 2:设定科学的预警阈值,替代经验化的预警线
日常传染病预警工作中,很多时候我们会用「过去 3 年同期均值 + 2 倍标准差」这类经验方法划预警线,但这类方法没法很好地适配发病的趋势变化和季节性波动。
ARIMA 模型可以直接输出预测值的 95% 置信区间,把置信区间上限作为预警阈值当实际监测的病例数超过上限时,就说明发病水平已经超出了既往正常波动范围,可能出现暴发或流行,触发预警。这种方法已经被广泛用在流感、手足口等传染病的自动预警中,比经验阈值更贴合数据本身的规律,也更符合科研论文的方法学规范。
场景 3:职称论文、监测报告的刚需方法,好上手易落地
对于需要写论文、做课题的疾控同行,ARIMA 是公共卫生领域时间序列研究的「入门标配」,因为它的认可度高,几乎所有公共卫生期刊都认可这个方法;对数据要求友好,只要有连续的发病 / 死亡监测数据就能建模;拓展性强,既可以单独做预测研究,也可以结合气象因素、防控政策做协变量分析,延伸出更多研究方向。
比起复杂的机器学习模型,ARIMA 原理清晰、操作简单,只要掌握基础流程,就能快速用到自己的数据分析里,是性价比极高的一项数据分析技能。
先给大家吃3个定心丸,这也是整个系列的创作原则:
1. 全程疾控场景,拒绝脱离实际的纯理论:不会一上来就堆公式、讲推导,所有概念都用传染病监测的例子讲解:讲平稳性,就用「流感上升期不平稳、散发期平稳」举例。
2. 碎片化学习,每篇只解决一个核心问题:单篇阅读时长控制在 15 分钟以内,不搞长篇大论的灌输:概念篇逐个拆解难点,不会一次性塞一堆术语。
3. 从入门到进阶,覆盖 90% 疾控应用场景:从最基础的「什么是时间序列」讲起,到基础 ARIMA 建模,再到疾控常用的季节性 SARIMA、带协变量的 ARIMAX,最后落地到预警、论文写作,形成完整的学习闭环。不需要你有统计专业基础,只要有基础的 R 软件操作能力,甚至零基础,都能跟着一步步学下来。
整个系列目前暂定共 11 篇,分为 6 个模块,循序渐进,从入门到实战:
课前准备需要的其实就是R,具体用到举例子的数据了我们后面也会分享:
1. 安装 R 与 RStudio/Positron:这是我们全程使用的分析工具,都是免费开源软件:先下载安装 R 基础包:官网 https://cran.r-project.org/ ,选择对应系统的版本即可,再下载安装 RStudio(操作界面):官网 https://posit.co/download/rstudio-desktop/ ,选择免费桌面版。
2. 安装必备的 R 包
library(fUnitRoots)参考:
《时间序列分析-基于R》. [M] .王燕.中国人民大学出版社出版
传染病预测预警技术及实践案例分析. [M]. 杨鹏, 王小莉. 人民卫生出版社
编辑:普通疾控人 | 审核:诗酒趁年华
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