2021年年底，岛内PTT曾有贴文指控时任台南市长黄伟哲当年在大学期间曾被台情治单位吸收，编号A143，之后又有周刊跟进报道，黄本人矢口否认。但根据台档案资讯网公开的“解密影像档案”，惊见台大农推系学生黄伟哲列为13名台教育部门人二处建议“继续直接布建名单首位”，考核还称黄伟哲“提供台大偏激学生社团参加各项违常活动资料，绩效卓著”，建议每月支薪从2000元增加为4000元。
根据台媒报道，“野百合”世代成员周克任16日在脸书公布“大专院校直接布建人员继续支薪名册”。这份资料其实已经公布在台档案局网站，全部259页，是台法务部门“调查局”的“强化校安工作案”（档号 AA11010000F/0077/206-01/02221）。
台大农推系学生黄伟哲列为13名台教育部门人二处建议“继续直接布建名单首位”。（台媒）
这259页公文出现多份布建名单，多为校内原有行政人员、教授。至于学生及员工部分，仅有1份13人名单。
第一栏显示，学校：台湾大学、姓名：黄伟哲、功能： 农推系学生，提供台大偏激学生社团参加各项违常活动资料，绩效卓著。联系人：程幻中、原支金额：2000、续支金额：4000。
黄伟哲16日上午出席活动受访时仅简短回应：“旧闻了”。但加拿大约克大学副教授沈荣钦提到，几年前“代号档”大学校园学生布建名册流出时，外界已推测相关人士身份，如今随着更多档案曝光，认为证据更加明确。
沈荣钦指出，他当年和黄伟哲不仅是因为同属异议性社团之故，同时也因为黄伟哲和他还同属另一个社团，就是把范云张冠李戴的学生报纸社团。“代号档”学生档案公布时，他们之中有些人还打趣道，每个人都和黄伟哲有交集，因为当时他几乎报名参加了所有的异议性社团，彼此甚至开玩笑说：“该不是为了绩效奖金吧？”如今得见档案，世间最残酷之事不是往事并不如烟，而是玩笑成真。
岛内周刊曾报道，“野百合”世代的黄伟哲，就读台大农推系时加入大学新闻社、当过代联会讯主编，还是浊水溪社创始社员。根据周刊掌握资料，黄伟哲从大一起就被教官盯上，要他回报社团动态直到大三，相关单位并以“误餐费”名义让他支领每次约1、2千元报酬，领据至今保留在台“促转会”卷证中。
对于曾被台情治单位吸收为线民，黄伟哲当年受访表示，他不否认教官有找过他，“但我没有同意要当线民，至于教官找过我之后，怎么去描述或如何向上呈报，这部分我无从得知，也不敢去过问，若干年后要说我是怎样怎样，坦白讲，我真的是没有办法认同”。
2021年年底，岛内PTT曾有贴文指控时任台南市长黄伟哲当年在大学期间曾被台情治单位吸收，编号A143。（台媒）
由于当时PTT网友公布的资料，只有A143的编号，指控是黄伟哲本人没有更为具体的证据，并未掀起波澜。但之后跟进报道的周刊强调，相关报道皆有所本，并经多方交叉查证及采访，亦有录音档为证。
如今随着更为具体的档案公布，上面清楚写着黄伟哲的名字，虽然当事人可用“旧闻”继续否认，但40年前档案记录者不可能穿越时空，预料黄伟哲之后的从政轨迹，若说眼前的白纸黑字通通是捏造，如此解释并没有什么说服力。
即将卸任台南市长的黄伟哲近期卖力打造行销人设，社群平台Threads上出现不少关于黄伟哲“默默出访行销水果”的讨论，但这些行销工作，本是观光局长该干的事。况且，在民进党用意识形态凌驾产业政策的错误路线下，绿媒大肆宣传的所谓“让世界吃到台湾的甜”，根本无法弥补失去大陆市场后的巨额缺口。
前绿委黄国书2021年遭媒体报道学生时期曾被吸收为线民，黄国书随后脸书贴文为当时的行为向所有朋友道歉，并退出民进党及党团运作，任期结束淡出政坛（台媒）
地方传言，黄伟哲卸任后的 “出路”，是回过头来参加“立委”补选。目标直指台南市第一大行政区-永康区。这项布局的契机源于现任“立委”林宜瑾的助理费官司案件，一旦判决有罪定谳，因涉及单一席次补选，该席次将面临改选。党内人士透露，民进党中央与地方已在推演，是否要将永康这一席与其他潜在缺额合并补选，而时机点极大可能落在下届市长选举过后，初步估计是明年3月。
在布局自己的政治未来之前，黄伟哲更该忠实面对过去。当年民进党前台中“立委”黄国书被爆出同样的事，便宣布退出政党运作，任期结束后淡出政治圈。黄伟哲假如真像一些侧翼形容的那样，是大熊，喜憨儿、台湾水牛，那他面对白纸黑字的档案记录，何须左躲右闪，仅以旧闻回应？对于当年是否被台情治单位吸收充当线民，也该像黄国书一样坦诚以对，回答到底是，还是不是？
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