军改前，在陕西西安驻扎着解放军第323、第451两所综合性的三级甲等部队医院，历史悠久、功勋卓著，且历史上均经历了多次的调整改编。但在此前的军改中，解放军第323医院、第451医院都已转隶空军、划入空军军医大学整合改建为如今的空军第九八六医院（也称西京医院九八六医院），具体由空军军医大学第一附属医院（西京医院）直接领导管理。
从历史发展脉络来看，解放军第四五一医院的最早建制前身是于1951年5月创建的“原西北军区空军第一医院”（西北军区空军便是兰州军区空军的前身），该医院主要担负西北地区空军部队的常规医疗保障和训练伤救治任务。1952年7月，医院进一步调整更名为“空军第五医院”，后又在1954年5月实施的空军医院统一整编中定名为“空军第四五一医院”。五年后的1959年2月，空军第四五一医院改称“空军西安医院”，由此成为西北地区唯一一所以驻地城市命名的空军中心医院，但“451”这个番号仍旧深深的烙印在医院发展进程中。
1994年7月，医院更名为“解放军第四五一医院”（仍隶属空军建制序列），1996年12月成功入选全国全军首批三级甲等综合医院行列。1999年，在当时的军区联勤体制改革中，解放军第四五一医院脱离空军序列，转隶兰州军区联勤部第28分部领导管理，之后在军改中的2016年2月进一步转隶至中部战区空军（重回空军“娘家”）。而解放军第四五一医院的最终改革归宿是在军改“脖子以下”阶段的2018年9月，这点咱们在本文末段统一介绍。
而解放军第三二三医院的历史则可以追溯至1968年，时称“总后勤部西安办事处门诊部”，初期规模不大、承担的医疗保障任务也比较有限，但经过两年时间的发展建设后已经同时展开有5个医疗所，至1968年8月正式组建为解放军第三二三医院。1972年8月，解放军第三二三医院迁往河南故县，后于1974年底重新迁回陕西西安。1975年，解放军第三二三医院已经达到了地区驻军医院的规模水平，医疗救治能力显著提升。1976年，医院移交兰州军区后勤部西安工程指挥部领导管理，1978年转隶兰州军区后勤部第28分部。1984年，医院由驻军医院升级为中心医院，1996年12月成为全国全军首批三级甲等医院，2016年转隶郑州联勤保障中心领导管理。
最后是在2018年9月5日，根据军委统一部署命令，以原解放军323、451两个三甲医院为基础，同时整合纳入12个院所门诊部（点）正式调整组建为空军第九八六医院，隶属空军军医大学、受西京医院领导管理，是军改后空军下辖的唯一一所中心医院、也是目前全军展开体量最大的中心医院。2021年1月，空军第九八六医院对外挂牌“西京医院第九八六医院”，实现了“西京同质化”管理，并依托西京医院积极学习先进技术、丰富诊疗经验、传承西京精神，全面提升服务水平。
现阶段，空军第九八六医院集医疗、教学、科研、保障于一体，上接西京、中融院区，下设南区（原解放军第323医院，陕西省西安市碑林区建设西路6号）、北区（原解放军第451医院，陕西省西安市友谊东路269号）两个院区，其中北区以手术科室为主，围绕战创伤救治调整优化；南区聚焦康复保健和特色专科集优统筹，着力打造为军服务、肿瘤、老年、康复、五官特色学科群。医院共开设门诊楼3个（分为门诊一部、门诊二部和门诊三部）、住院部4个（分为住院一部、住院二部、住院三部、住院四部），展开床位1385张，并拥有2500平米的健康体检中心、4500平米的军人特诊中心。
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