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核仁是细胞内最大的无膜生物分子凝聚体,由纤维中心(FC)、致密纤维组分(DFC)、颗粒组分GC三层亚结构组成,是核糖体合成的核心场所。细胞遭受DNA损伤、转录抑制等应激时,核仁结构会外翻形成暗核仁帽(dark nucleolar cap, DNC)结构。既往研究发现,核仁可依靠蛋白电化学特性建立不依赖ATP质子泵的pH梯度,维持凝聚体的结构与功能稳态。经典核斑剪接因子SRSF1的功能仅局限于mRNA剪接,其是否参与核仁应激响应、调控凝聚体pH微环境尚无相关报道。

2026年9月28日,厦门大学王波团队在Nature Chemical Biology在线发表了题为SRSF1 modulates the dark nucleolar cap pH to restore nucleolar integrity and function的研究论文,初步阐明了SRSF1调控核仁应激稳态的全新机制。

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研究证实,在rRNA合成受阻的应激条件下,SRSF1从核斑特异性地迁移至DNC结构,而不是富集于常规核仁亚区。该现象普遍存在于多种肿瘤细胞。SRSF1 的N端RRM1结构域是其DNC定位的核心元件,且应激条件下SRSF1可与核仁解旋酶DDX18形成复合物,是SRSF1转运至DNC的重要条件。进一步研究发现,DNC拥有独特的碱性pH微环境,与核斑及其他核仁亚区理化特性完全不同。SRSF1及其家族成员可维持DNC碱性微环境,而C端arginine/serine-rich (RS)无序结构域的高净正电荷是介导DNC碱化的关键,并且该功能独立于其经典的RNA剪接作用。SRSF1缺失会导致应激后核仁结构重塑异常、rRNA加工受阻、DNA损伤累积,只有携带完整高正电荷RS结构域的SRSF1才能修复上述缺陷。团队基于该特征合成的高正电荷RA串联多肽,可特异性靶向核仁,有效修复核仁应激损伤、恢复rRNA加工功能。

综上,本研究首次揭示经典剪接因子SRSF1依靠蛋白一级序列的电荷特征调控生物大分子凝聚体pH梯度形成。拓展了生物凝聚体pH调控模型,再一次证实生物凝聚体pH梯度由蛋白固有的带电氨基酸序列决定,也揭示了RS结构域的全新非剪接功能。

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厦门大学生命科学学院已毕业博士生马绥斌、已毕业硕士生郭杰睿为共同第一作者,硕士生詹翔、博士生吴凡、已毕业硕士生杨朔为本研究做出重要贡献。王波教授为通讯作者;厦门市第五医院黄超群为本研究提供了关键实验技术支撑。

王波团队长期聚焦生物凝聚体相分离与电荷调控机制,此前在Molecular Cell发表研究阐明SRRM2磷酸化电荷块调控核斑融合的分子机制,本次工作延伸至应激下DNC的pH电荷调控,系统建立“蛋白电荷-凝聚体理化特性-细胞应激稳态”的研究体系。

https://www.nature.com/articles/s41589-026-02316-9

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