一颗种子埋进土里,萌发、长叶、抽穗、开花、结实——这整个过程里,每个细胞在什么时间、什么位置、打开了哪些基因,过去没人能完整说清楚。现在,一张覆盖水稻全生命周期的三维时空细胞图谱被构建出来了。

据央视新闻报道,这项由我国多个科研机构分工协作完成的研究成果,于10月6日晚在国际学术期刊《细胞》(Cell)在线发表。研究团队在全球范围内首次构建了覆盖水稻从种子萌发到开花结实全过程的三维时空细胞图谱。

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三套测序数据拧成一张图

这张图谱不是单一技术的产物。它整合了基因组测序、单细胞测序与空间转录组测序三类数据,把基因表达的信息放回到具体的细胞和空间位置上。简单说,不只是知道哪个基因开了,还知道它在哪片组织、哪个发育阶段开的。

对育种来说,这个区别很关键。据种业科研人员介绍,明确特定功能基因在水稻全生育期、不同组织中表达的位置,将开辟一条快速实现高产稳产的精准设计育种新路径。

从“顾此失彼”到“指哪打哪”

过去改良水稻的某个性状,常常遇到一个麻烦:直接改动特定基因,可能连带影响多个性状,按下葫芦浮起瓢。有了图谱和模型之后,专家们有望进行定向优化,减少这种不利的连锁反应,探索更有针对性的调控策略。

配套的资源也已经建好。科研人员建设了可供全球研究者使用的数据库与水稻单细胞基础模型,支持基因查询、空间表达展示和比较分析。研究者可以围绕自己关注的基因,查看它在不同组织和发育阶段中的表达情况,并进一步确定实验验证的方向。

从种子萌发到开花结果,一棵水稻的完整生命过程,正在被拆解成可查询、可比较的数据。