应当说，从明太祖朱元璋起时，就十分注重经营东北，如在明洪武初年就设立了辽东司，明洪武二十年（1387年）六月，于金山（吉林省农安县附近）大破元军之后，朱元璋更是进一步加强了对松花江以北女真各部的统治。

而明成祖朱棣一即位，更是根据女真各部“相率来归”、“悉境来附”（都是归属的意思）的情况，还于永乐七年（1409年），特别设立了奴儿干都指挥使司，进行对女真各部的管辖。

至明成祖朱棣、明仁宗朱高识、明宣宗朱瞻基祖孙三代之时，女真各部酋长们更是拿着政府颁发的“印信”，定期为明朝政府纳贡，并为明政府保守疆界；中央有所调用，他们也是闻命即从，决不违期。

就是到了明宪宗成化年间（1465年--1487年）仍保持着这种状态，而汉族与女真族之间的贸易往来，不仅频繁，更是热闹和融洽。

总之，明朝初年一直到努尔哈赤，明朝与建州女真的关系都是这样，到努尔哈赤时，他还曾被明朝封为“龙虎将军“。

可是，自清军入关后，清朝历代皇帝却开始忌讳起这段历史，他们更不愿意让人们清楚他们的祖先与明朝的关系，即便是清朝写的一些历史书，也把这几百年间建州女真和明朝的关系给整个取消了，把这段真实的历史给隐瞒起来了。还说他们的祖先从来就是独立的，跟明朝没有任何关系。

不但如此，凡是记载他们的祖先与明朝关系的历史书，他们都想办法搜集起来毁掉。如《四库全书总目提要》里有一部分禁毁书目，主要就是两类：一类是书里面有某些文章对清朝表示不满，另一类便是牵涉到他们祖先的。

那么，这究竟是为什么呢？

首先，自从他们建立起大清朝之后，他们便开始以为自己是人类最高贵的民族，与明朝（汉族）有着根本的区别。

其次，隐藏起这段历史，其目的就是想掩盖起当年努尔哈赤的一些不为人知的事实，尤其为达到建州女真争霸天下的目的，对辽东人民所进行血腥行为，以及为达到个人目的，而不得不向镇辽总兵李成梁卑躬屈膝等丑恶行为等。

再次，也是最根本的一点，就是通过否定努尔哈赤和建州女真与明朝的依附关系，想从根本上绕开”以下犯上“等儒家道德思想束缚，给自己夺得明朝天下讨一个好名声。