智慧芽生物序列数据库重磅上线“化学修饰检索”功能|化学修饰检索|序列|文献|算法

近日，科技创新与知识产权信息服务商智慧芽旗下生物序列数据库重磅推出“化学修饰序列检索”功能。“化学修饰检索”功能是继2023年智慧芽生物序列数据库推出“通式检索”功能后的全新突破。生物序列数据库以其卓越的功能和深度的数据覆盖，在生物信息学领域再次树立了新的里程碑。

“化学修饰检索”挑战重重，智慧芽破局行业盲点

随着小核酸多肽赛道的热度飙升，序列的设计和修饰是开发这些领域有效药物的关键步骤，同时也是知识产权保护的重要策略点。智慧芽生物序列数据库产研团队通过对国际制药企业的深入调研揭示了一个现实挑战：在缺少高效自动化工具的背景下，研发与知识产权专业人员不得不依赖初步目标设定和手动检索专利信息的策略，且需频繁更新。此外，专利文件中对化学修饰的隐晦描述进一步增加了这一过程的复杂性，显著提升了侵权风险管理的难度。

序列的化学修饰是指对核酸（DNA、RNA）或蛋白质等生物大分子结构的改变。这些修饰涉及在序列中的特定位点引入化学基团或做其他结构变化，从而改善它们的特性或功能。例如2'-氧甲基（2'-OMe）修饰：在siRNA的核苷酸中，2'-羟基被甲基基团取代，这种修饰可以提高siRNA的稳定性，增强对RNA酶的抵抗力。类似的还有磷酸二酯（phosphorothioate）修饰、胆固醇修饰（5’-Chol，3’-Chol）等。

化学修饰方式可以根据经验、专利文献结合具体的实验需求和应用场景进行选择和组合，以提高目标产品性能，改善治疗效果。然而，目前全球商业数据库中，鲜有支持通过修饰类型和修饰位点实现一键式检索，覆盖所有相关序列和专利，导致专业人员不得不依赖耗时的关键词搜索和专家筛选。

具体来看，当前化学修饰序列检索在以下两大关键领域呈现出显著的紧迫性和重要性：

1.研发效率提升：有效的化学修饰检索工具能够助力研发团队精确识别和分析目标蛋白的修饰状态，从而加速药物发现和分子设计的过程，提升研发效率和成果的转化潜力。

（1）靶标识别：对于专注于信号传导机制的研发团队，通过检索具有特定化学修饰（如磷酸化）的序列，能够精确识别并锁定潜在的靶标蛋白，从而加速药物发现过程。

（2）药物优化：研发人员通过分析不同化学修饰对分子的半衰期和稳定性的影响，可以优化药物候选物的性能，以期达到更高的疗效和安全性标准。

2.IP战略保护：对化学修饰的深入理解和快速检索对于IP专业人员至关重要，有助于在激烈的市场竞争中维护其知识产权优势，规避潜在的法律风险。

（1）可专利性分析：IP团队通过细致梳理现有文献和专利资料，评估特定化学修饰的新颖性。通过比较目标修饰与已知修饰，他们能够识别出可能支持专利申请的独特特征。

（2）FTO评估：IP专家需对现有知识产权进行全面审查，以确定新发现的化学修饰是否可能侵犯他人的专利权。这包括分析特定修饰的使用情况、相关文献记录等，以确保研发活动不会引发知识产权纠纷。

对此，智慧芽着力攻坚，在旗下生物序列数据库中，全新推出“化学修饰检索”功能，破解传统费时费力的化学修饰检索难题。

助力用户高效检索序列的化学修饰

过去，专业人员只能按序列查看化学修饰，现在使用智慧芽生物序列数据库的化学修饰检索功能，即可直接通过化学修饰检索序列和专利，无需再手动整理。

图：智慧芽生物序列数据库化学修饰检索入口

首先，面对专利文献中对序列修饰的描述缺乏统一标准，导致差异巨大的现状。用户以前在进行关键词搜索时，必须手动包含所有可能的修饰，极易导致关键专利的遗漏。现在，智慧芽生物序列数据库成功为众多序列修饰建立了标准化的检索体系，并将持续迭代优化，以确保用户能够准确、全面地获取所需信息。

图：支持标准化化学修饰体系勾选

其次，用户以往在搜索具有相同修饰类型的序列，尤其是特定位点的序列时，面临极大的困难：工作流程复杂，通常需要结合基础序列搜索和修饰类型关键词搜索，采取多策略并行的方法。现在，通过智慧芽生物序列数据库的化学修饰检索功能，用户无需序列信息即可直接搜索特定修饰类型的序列，极大简化了检索流程，显著提高检索的精确度和效率。

图：无序搜索更深洞察研发思路

第三，传统的检索方法无法直观显示整个化学修饰检索结果，而单独查看每篇专利中的化学修饰又可能会遗漏关键信息，如常见的修饰类型、最优的修饰位点或该领域的热门研发趋势等。现在，智慧芽生物序列数据库列表页的"修饰总览"，能够让用户快速识别整个数据结果中化学修饰的分布，并支持导出报告。

图："修饰总览"一览修饰全貌

数据+算法+产品，全方位赋能“化学修饰检索”功能

智慧芽生物序列数据库“化学修饰检索”功能的成功打造，离不开数据、算法与产品的坚实支撑。

从数据维度看，智慧芽生物序列数据库收录了智慧芽数据专家团队人工整理的67万数据，以及提取专利序列列表中的84万化学修饰数据，共计150万修饰序列，供用户搜索查询，并打造了涵盖9大类别、382个子类的化学修饰标准化体系。

从算法维度看，智慧芽拥有先进的全局比对算法，适用于大部分具有显著相似性的序列，将会返回更好的结果，尤其适用于短序列检索。

从产品维度看，当前产品的检索界面清晰易用、功能齐全、检索结果数据全面详细，可支持导出报告，并可追溯命中修饰数据的来源，如：

1.构建检索式

2.检索结果页

3.修饰总览生成修饰检索报告

4.查看序列详情