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编辑丨王多鱼

排版丨水成文

理解冠状病毒的刺突蛋白( Spike protein ) 的构象变化,对于开发广谱疗法至关重要。刺突蛋白的氨基酸残基 815-825 位点(以 S2′ 位点为中心) ,即 Spike815-825 是冠状病毒的超广谱抗原表位,其在融合前构象中通常被隐藏, 但在与 ACE2 结合时(即病毒入侵细胞时)会短暂暴露。因此, 该表位可作为药物及疫苗设计的靶点。

2026 年 5 月 6 日,复旦大学生物医学研究院/上海市重大传染病与生物安全研究院孙晓玉研究员、孙蕾研究员,广州医科大学王延群教授及复旦大学基础医学院谢幼华研究员作为共同通讯作者(包智恒刘治民张昭勇为论文共同第一作者),在国际顶尖学术期刊Nature上发表了题为:Steric hindrance of antibody binding in an Omicron spike fusion intermediate 的研究论文。

该研究揭示 SARS-CoV-2 入侵细胞瞬间超广谱靶点Spike815-825 的动态变化,进一步阐明了奥密克戎变异株的全新逃逸机制,在此基础上提出了“抗体小型化”策略,可显著增强对多种奥密克戎亚变体及其他人冠状病毒的抗病毒活性,为开发下一代高效、广谱的抗冠状病毒药物指明了新方向。

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在这项最新研究中,研究团队通过整合功能与结构分析,发现靶向 Spike815-825 表位的抗体 76E1 能特异性识别一种早期融合中间构象,其中该表位呈现为螺旋结构(研究团队将其称为S2′-helix)。

研究团队进一步发现,SARS-CoV-2 奥密克戎变异株通过以下机制逃逸靶向该表位的抗体:早期融合中间构象中 S2′-helix 位移导致的立体阻碍、S1 结构域与 ACE2 距离受限,以及其更依赖组织蛋白酶介导的进入途径(该途径削弱了 76E1 对 S2′ 切割的抑制)。其中 H655Y 突变是逃逸的关键机制。

抗体的大小直接影响其接近 S2′-helix 的能力。重要的是,减小抗体尺寸能够逆转上述逃逸机制,并显著增强对奥密克戎变异株及其他人类冠状病毒(包括 SARS-CoV-1 和 HCoV-229E)的中和活性。

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S2'-helix 抗体中和与奥密克戎逃逸机制模式图

总的来说,这些发现确立了靶向 S2′-helix 的抗体小型化策略作为开发泛冠状病毒疗法的可行路径,为开发下一代高效、广谱的抗冠状病毒药物指明了新方向。

总的来说,这项研究通过结构功能分析,阐明了冠状病毒刺突蛋白的动态构象变化如何影响抗体中和效果,确立了靶向 S2′-helix 的抗体小型化策略是突破奥密克戎等变异株免疫逃逸,开发下一代高效、广谱抗冠状病毒药物的关键路径。

论文链接

https://www.nature.com/articles/s41586-026-10462-2

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