目前,UKB数据库相关研究仍不断出现在高分期刊:
本文整理了医咖会《UK Biobank介绍及应用研究》专栏对该数据库数据的描述。正在考虑使用该数据库的伙伴,可以点击左下角“阅读原文”查看完整视频进一步了解。
UK Biobank(UKB)与常见的老龄化数据库,比如中国健康与养老追踪调查CHARLS和美国健康与营养调查NHANES不太一样,UKB主要调查基线暴露情况与未来结局之间的关联,理解基因、生活方式、环境在疾病与健康中的相互作用。
基线调查时,UKB全面收集了参与者的数据资料,包括人口学信息、生活方式、体育锻炼、环境因素(空气、绿化)等等,同时UKB通过链接健康记录或者直接联系参与者持续跟踪健康数据、通过问卷调查获取认知功能和心理健康状况,此外还进行了血液、尿液等生物样本的采集。
这些样本的采集花费了大量的时间,同样也获得了丰富的信息。
常规调查
眼部数据
血液生化指标
代谢组学
UKB包含昂贵的靶向代谢组学数据,以脂质组学为主的定量数据,生物标志物跨越多个代谢途径,包括了14个亚类中的的脂蛋白和各种低分子量的代谢物。
蛋白组学
UKB与药企合作,调查了5万多名参与者的血浆蛋白质组特质,拥有2000+NPX数据,通过了严格质检,发布后可以直接使用。
基因分型数据
近年孟德尔随机化分析备受青睐,其所依赖的GWAS中的大量基因分型数据就来自于UKB。得益于超大样本量的基因数据,UKB多次登上《Nature》封面。UKB有约45万人的基因数据可供下载和使用,包括使用定制基因分型芯片850k SNPs和插补基因信息90M SNPs。不同疾病和性状的GWAS结果在持续公布。外显子和全基因序列数据可以在UKB-RAP平台使用分析。
影像数据
已有约10万人的影像数据可以下载使用。如果不会分析MRI图像,UKB使用了先进的自动化机器学习算法,计算了数千个可以直接使用的图像衍生表型,包括全脑体积、海马体积等等。
健康相关结局
UKB健康结局并不是来源于自我报告,而是链接英国国家卫生系统(NHS)数据库进行实时更新(半年-1年进行一次更新),目前已有大量死亡、癌症及其他健康结局数据,通过ICD9和ICD10可以区分超过1000种疾病,预计未来会有更多的可用数据,助力研究者获得阳性结果。
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