责编 | 王一
代谢基因簇 (Biosynthetic Gene Cluster) 由多个来源于不同酶家族的基因在染色体上相邻或是相近的位置组成。近十年来的研究发现,许多参与植物防御和具有重要医药价值的植物次生代谢物由植物代谢基因簇编码合成,但对此类基因簇的形成过程、生理功能以及进化等方面知之甚少。
近日,海南大学罗杰教授团队在Science Bulletin杂志发表了题为An Oryza-Specific Hydroxycinnamoyl Tyramine Gene Cluster Contributes to Enhanced Disease Resistance的研究论文,揭示了一个稻属特异的芳香族酚胺代谢基因簇的生化基础及其在水稻广谱抗性方面的作用,为植物代谢基因簇的形成机制和进化模式提供了新见解,也为作物抗性遗传改良提供了新资源。
罗杰团队综合利用基于代谢物的全基因组关联分析 (mGWAS) 、体外酶活力测定、植物稳定转化和烟草瞬时表达等多种手段在水稻10号染色体上定位并鉴定了一个芳香族酚胺基因簇—羟基肉桂酰酪胺 (HT) 基因簇,该基因簇由1个吡哆醇5'-磷酸氧化酶,1个酪氨酸脱羧酶和2个酰基转移酶组成,拓展了对代谢基因簇酶类组成的认识。其终产物羟基肉桂酰酪胺具有植物抗毒素效应,能够显著提高水稻病害 (白叶枯和稻瘟病) 的抗性。
比较基因组学证据显示转座子 (TEs) 在HT基因簇关键组分的组装中发挥重要作用,提示该基因簇的形成兼具“解毒”和“抗病”双重功效。进一步的进化分析表明,HT基因簇在稻属AA基因组分支中特异存在,其关键组分在这些植物的基因组中存在基因拷贝数和相对位置的变异。
Genome mining and function validation of HT gene cluster in rice.
综上所述,该研究揭示了水稻芳香族酚胺基因簇的生化基础及其在水稻抗病中的可能作用,不仅为作物抗性遗传改良提供了新资源,也为植物中代谢基因簇的形成机制和进化模式提供了新的见解。
海南大学罗杰教授为该论文的通讯作者,华中农业大学生命科学技术学院博士研究生沈双欠和已毕业博士研究生彭梦为共同第一作者。中国农业科学院植物保护研究所宁约瑟研究员、德国马普研究所Alisdair R. Fernie教授和华中农业大学袁猛教授等共同参与了该项研究。
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2095927321002322
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