α-变形菌纲—根瘤菌目（下）
6.生丝微菌科

生丝微菌科（Hyphomicrobiaceae），是根瘤菌目的一科光合细菌。该属的模式属为生丝微菌属(Hyphomicrobium)。

（1）芽生绿菌属

芽生绿菌属（Blastochloris）是光合细菌下的紫色非硫细菌，是生丝微菌科的一属革兰氏染色阴性菌。细胞呈杆形至卵圆形。该属的模式种为绿硫芽生绿菌(Blastochloris sulfoviridis)。

形态描述：杆形至卵圆形，生长具极性，不对称的出芽分裂。有时可看到玫瑰结形细胞聚合体。依靠亚极生鞭毛运动。革兰氏染色阴性。光异养厌氧生长。也可能进行黑暗微好氧生长。光养生长细胞含有片层状光合内膜，且平行于细胞内膜。光合色素为叶绿素b和类胡萝卜素。光培养物的颜色是绿色至橄榄绿。含有Q-8、Q-10、MK-7、MK-9。G+C mol%范围为66～71。16S rRNA序列在光合菌中与红游动菌属(Rhodoplane)最近。属α-2亚群。

（2）生丝微菌属

生丝微菌属（学名：Hyphomicrobium）为生丝微菌科的一个属。该属的模式种为普通生丝微菌（Hyphomicrobium vulgare）。

生丝微菌属指的是一属可进行分枝丝状生长、在菌丝顶端进行出芽繁殖的杆菌。细胞大小为〔05一 1.0)又(l一3)拜、外形为末端尖细的杆状、卵圆形、卵形或豆形，也会长成分枝丝状。菌丝不分隔。革兰氏染色不明。在菌丝顶端会长出能运动的芽。芽体附着物体后即丧失运动能力而作丛生生长。在固体培养基上生长缓慢，形成微小菌落。化成有机营养但生长需要二氧化碳能利用甲醇、甲胺等一碳化合物作惟一碳源和能源。可好氧生长或利用硝酸盐作厌氧生长。生活在土壤、淡水、半咸水和海水咋‘。G一}C mol%值为59一67。

（3）红微菌属

红微菌属（Rhodomicrobium）是光合细菌的紫色非硫细菌，是生丝微菌科的一属革兰氏染色阴性菌。细胞呈卵圆形至长卵圆形。该属的模式种为万尼氏红微菌(Rhodomicrobium vannielii)。

7.甲基杆菌科

甲基杆菌科（学名：Methylobacteriaceae）为根瘤菌目的一科细菌。此科的模式属为甲基杆菌属(Methylobacterium)。

甲基杆菌属（学名：Methylobacterium）为生丝微菌目甲基杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。杆状。分离于土壤、尘土、淡水、湖泥、叶表、瘤、稻谷和医院环境。此属的模式种为嗜有机甲基杆菌(Methylobacterium organophilum)。

甲基杆菌属，一属兼有甲基营养和甲烷营养特性的G-杆菌，也可用葡萄糖或其他复杂营养物作碳源和能源。杆状，0.8～1.0μm×1.0～8.0μm。单个或罕见成簇，也罕见分枝或多形态。以单极毛、亚极毛或侧生鞭毛运动，有的菌没有强烈的运动。细胞常含有大的嗜苏丹颗粒，有时有异染粒。细胞革兰氏阴性，有的菌株为革兰氏染色可变，代表菌株具有革兰氏阴性细胞多层细胞壁结构和柠檬酸盐合成特性。

多数菌株生长缓慢，有的不能在营养琼脂上生长；在甘油-蛋白胨琼脂上的菌落直径为1～3mm。浅粉到亮橙红色。在甲醇-无机盐琼脂上菌落为更均一的浅粉色。色素是非水溶性，可能是类胡萝卜素。在液体培养基中会形成粉色表面菌环或菌膜。严格好氧，氧化酶和接触酶(常弱)阳性。化能异养菌，兼性甲基营养菌和罕有兼性甲烷营养菌。有的菌株可利用甲烷作为惟一碳、能源，但如在无机培养基上不能维持甲烷环境，该特性很易丧失。有报道代表菌株能消化C1化合物和同型柠檬酸途径(icl-途径)。当在复杂的有机培养基上有完整的三羧酸循环。该属成员分离于土壤、尘土、淡水、湖泥、叶表、瘤、稻谷和医院环境。最适温度25～30℃，包括8个种。

8.甲基孢囊菌科

甲基孢囊菌科（学名：Methylocystaceae）为根瘤菌目的一科细菌。此科的模式属为甲基孢囊菌属(Methylocystis)。

甲基孢囊菌属（学名：Methylocystis）为甲基孢囊菌科的一个属。该属的模式种为（Methylocystis parvus）。

9.叶杆菌科

叶杆菌科（学名：Phyllobacteriaceae）为根瘤菌目的一科细菌。此属的模式种为叶杆菌属(Actinobacillus lignieresii)。

氨基杆菌属（学名：Aminobacter）为叶杆菌科的一属细菌。该属的模式种为嗜氨基氨基杆菌（Aminobacter aminovorans）。

污水菌属（学名：Aquamicrobium）为叶杆菌科的一属真菌。该属的模式种为污水水微菌（Aquamicrobium defluvii）。

螯合杆菌属（学名：Chelatobacter）为叶杆菌科的一个属。该属的模式种为何氏螯合杆菌（Chelatobacter heintzii）。现为氨基杆菌属（Aminobacter）的异名。

中慢生根瘤菌属（学名：Mesorhizobium）也称中间根瘤菌属，为叶杆菌科的一个属。该属的模式种为百脉根中慢生根瘤菌（Mesorhizobium loti）。

叶杆菌属（学名：Phyllobacterium）也称叶瘤杆菌属，为叶杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。直杆状（体外）。出现在高等植物（紫金牛科和洋槐科-茜草属）的叶肿瘤中。此属的模式种为紫金牛叶杆菌(Phyllobacterium myrsinacearum)。

10.红菌科

红菌科（学名：Rhodobiaceae）为根瘤菌目的一科细菌。此科的模式属为(Rhodobium)。

11.黄色杆菌科

黄色杆菌科（学名：Xanthobacteraceae）为根瘤菌目的一属细菌。此科的模式属为黄色杆菌属(Xanthobacter)。

（1）屈曲杆菌属

屈曲杆菌属（学名：Ancylobacter）也称弯杆菌属，为黄色杆菌科的一属真菌。该属的模式种为水生曲杆菌（Ancylobacter aquaticus）。

（2）角微菌属

角微菌属（学名：Angulomicrobium）为黄色杆菌科的一属真菌。该属的模式种为四联角微菌（Angulomicrobium tetraedrale）。

（3）水杆菌属

水杆菌属（学名：Aquabacter）为黄色杆菌科的一属真菌。该属的模式种为圣灵湖水杆菌（Aquabacter spiritensis）。

（4）固氮根瘤菌属

固氮根瘤菌属（学名：Azorhizobium）为黄色杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。杆状。菌株能在田菁属(长喙田菁Sesoonia rostrata)的根和茎上生瘤。此属的模式种为基瘤固氮根瘤菌(Azorhizobium caulinodans)。

（5）耗甲基杆菌属

耗甲基杆菌属（学名：Methylorhabdus）为黄色杆菌科的一属真菌。该属的模式种为多噬耗甲基杆菌（Methylorhabdus multivorans）。

（6）微环菌属

微环菌属（学名：Microcyclus）为黄色杆菌科的一属真菌。该属的模式种且为唯一种为水生弯杆菌（Microcyclus aquaticus）。

（7）黄色杆菌属

黄色杆菌属（学名：Xanthobacter）为黄色杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。杆状细胞。在含腐烂有机物的湿土和水中都可出现。此属的模式种为自养黄色杆菌(Xanthobacter autotrophicus)。

黄杆菌科中的一属G-细菌。栖居于土壤、水体、生肉、牛奶和临床样品中。细胞杆状，两端钝圆，大小为0.5μm × 1.0～3.0μm，不运动典型菌种都含有橙或黄色非荧光性不溶于水的色素。好氧菌，化能有机营养型。进行呼吸性代谢。在蛋白胨含量低的培养基中，可利用糖产酸而不产气。过氧化氢酶阳性，氧化酶阳性。G+C mo1%值约31～42。已知种达40种(2000年)。模式种是水生黄杆菌。

会引起人类致病的黄杆菌主要有以下数种：脑膜脓毒黄杆菌，可引起新生儿暴发性化脓性脑膜炎，传染源主要是女性生殖器感染；短黄杆菌，存在于人体的眼分泌物、痰、血和尿中；香气黄杆菌，存在于肠道病人粪便中，在尿、血、痰、创伤和溃疡等标本中也有发现；多食黄杆菌，从眼、咽分泌物，肺活检标本，以及血液腹水、尿、脑脊液和伤口脓汁中均可存在，可引起腹膜炎；食醇黄杆菌，可从血、尿、腹水、痰、骨髓、阴道分泌物中分离出。本属细菌对青霉素、卡那霉素、庆大霉素、多黏菌素B等大多数抗生素呈耐药性，对红霉素、四环素、新霉素和萘啶酮酸等较敏感，故治疗较困难。