1989年的一天，在秦城监狱服刑的王洪文，与其他犯人一起在院子里拔草劳动，但他走着走着突然一头栽倒在地，口吐白沫，面部抽搐，完全是一副不省人事的模样。

过了一个多小时后，王洪文被送到附近的医院检查，医生发现他不仅患有癫痫，还得了很严重的肝炎。考虑到他的身体状况，监狱适当改善了他的伙食条件，每个月供应一次牛奶和水果。除此之外，适量地减少了他的户外劳动量。

1992年初，王洪文在监狱的例行体检中被查出患有肝癌，本着人道主义的原则，上级安排一位医生到监狱给他做了检查。

不久后，王洪文在狱中病亡，终年58岁。他的遗体送往郊区的火葬场火化，他的妻子和弟弟作为家属代表领回了骨灰。