最新资讯 |科学家揭示肠道真菌菌群对人体健康影响;生物工程新方法治疗艰难梭菌感染;新冠病毒改变感染细胞RNA首次获证
近日,左涛研究团队在《柳叶刀·微生物》发表综述,揭示肠道真菌菌群对人体健康和肠道稳态的重要作用;黄林峰副教授等人的研究揭示了艰难梭菌感染造成组织损伤的关键基因片段,阻断特定的基因功能,可能有助于治疗艰难梭菌感染;通过分析研究病毒、人类和动物细胞RNA获得的13个数据集,科学家首次证明,新冠病毒会改变宿主细胞RNA的功能。本期最新资讯带您快速浏览近期(11月7日-11月13日)热点话题。
我国科学家揭示肠道真菌菌群对人体健康影响
近日,左涛研究团队在《柳叶刀·微生物》发表综述,揭示肠道菌群对人体健康和肠道稳态的重要作用。
肠道真菌菌群是人类肠道微生物组中一个微小但非常关键的组成部分,参与调节宿主免疫同源性、病理生理过程以及共存于肠道的细菌微生物组的组装。过去十年里多项研究结果表明,肠道真菌菌群协同肠道细菌菌群会影响人类健康和疾病的形成发展。
该综述回顾了健康人群从出生到成年过程中肠道真菌菌群的组成与功能多样性。从影响肠道菌群的因素(包括饮食、药物、年龄、遗传和免疫功能)、肠道真菌菌群在疾病和治疗中的作用,特别是它们与肠道细菌菌群对宿主免疫的协调作用等角度进行分析,并对肠道真菌菌群的基本组成和转化研究的最新进展进行综述,明确了致病性、益生性和条件性真菌在疾病发生过程中的作用,强调了肠道真菌—细菌的相互作用在宿主生理学和病理生理学中的生态效应。
生物工程新方法阻断部分基因功能,治疗艰难梭菌感染
艰难梭菌(Clostridium difficile)是一种抗生素耐药菌,在使用抗生素,尤其是过量使用抗生素时,很容易出现艰难梭菌感染(CDI)。通常,艰难梭菌通过口腔进入人体内并保持休眠状态,直到在大肠中感染并释放毒素,破坏组织。这些毒素会杀死细胞,从而导致腹泻、腹痛、发烧,在极端情况下会致命。
美国微生物学会期刊《mBio》发布黄林峰副教授等人的研究成果。该研究揭示了艰难梭菌感染造成的组织损伤的关键基因片段,阻断特定的基因功能,有可能用于治疗艰难梭菌的感染。
黄林峰表示,艰难梭菌感染是一个全球性的公共健康问题,在中国,艰难梭菌感染的影响也非常广泛,但是对它的研究还不充分。
研究发现,在艰难梭菌导致的细胞凋亡中,有几个新的基因发挥了重要作用。通过阻断这部分的基因功能可减轻艰难梭菌毒素所造成的细胞死亡,而这个方法可以用于感染后的相关治疗。中药化合物甘草甜素(Glycyrrhizin)能够阻断其中一个候选基因HMGB1的功能。测试结果表明,其对艰难梭菌毒素引起的细胞和组织损伤具有强大的保护作用。
传统治疗艰难梭菌感染的方法是使用更强的抗生素,包括万古霉素(vancomycin)、非达霉素(fidaxomicin)和甲硝唑(metronidazole),但是治疗后常有复发。
黄林峰副教授的研究主要有两个创新点,一是从寻找艰难梭菌感染的宿主因子出发,二是使用自创的高效、经济的RNAi基因筛查方法。
在实验中,黄林峰团队使用一种自创的新型基因筛选方法,即用生物工程的方法来生产siRNA(小干扰RNA)分子。该方法的好处在于可以降低成本,简单、便宜地生产高效的小干扰RNA;并且可以针对特定细胞和研究体系进行个性化的生产,因此更加精准和高效。
目前,黄林峰团队正使用该新型基因筛选方法研究其他疾病,希望能开发出更多基因靶向精准医疗的候选药物。
新冠病毒改变感染细胞RNA首次获证
通过分析研究病毒、人类和动物细胞RNA获得的13个数据集,科学家首次证明,新冠病毒会改变宿主细胞RNA的功能。相关论文发表于最新一期《细胞与感染微生物学前沿》杂志。
在本研究中,科研团队通过直接RNA测序,检测了源于猴子的Vero细胞和源于人的Calu-3细胞的外转录组——细胞RNA生化修饰(如甲基化)的集合。他们通过分析细胞中存在的所有RNA,定位核苷酸每个区域甲基化的数量,定性地证明了感染细胞RNA的变化。
论文作者表示:“这项研究中,我们第一个重要发现是,与未感染细胞相比,感染新冠病毒增加了宿主细胞内m6a(N6甲基腺苷)的浓度——一种甲基化。”
研究小组还发现,不同毒株核苷酸中的含氮碱基序列存在差异。有些毒株可能比其他毒株甲基化程度更高。如果是这样,它们可以在宿主细胞内更好地增殖。
在完成了新冠病毒如何修饰宿主细胞内m6A的研究后,科学家们计划进一步分析存储的数据,以寻找病毒RNA甲基化水平与每个感染细胞释放病毒数量——即病毒暴发规模之间的相关性。
病毒甲基化程度越高,病毒暴发的规模也就越大。这些发现为研究新冠肺炎新疗法和现有药物的重新利用奠定了基础,还有助于更深入地了解病毒株如何逃避免疫系统。
文献索引:《柳叶刀·微生物》、《mBio》、《细胞与感染微生物学前沿》
文稿撰写:Cumeia
文稿校对:Soda
文稿排版:Chris
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