体制内的行政单位中，副科级干部包含两种情况，一种是领导职务序列当中的乡科级副职，比如副镇长、副科长、县直单位中的副局长等；一种是非领导职务，也就是职级序列中的四（三）级主任科员。两者同属副科级，只不过一个实职，一个虚职。
在事业单位内部，副科级干部通常也包含两种，一种是管理八级岗工作人员，属于领导岗位；一种是县以下事业单位的管理岗人员，通过职员等级晋升享受八级职员待遇的普通管理人员，不改变管理权限。
因为四级主任科员或者三级主任科员，包括县以下事业单位管理岗八级职员，其实说到底都是职级序列，非领导职务。尤其是行政机关，按照相关规定，硕士研究生学历上岸转正后，可以直接定级为四级主任科员，谈不上提拔，包括职级晋升和职员等级晋升等，严格意义上讲都不是干部提拔，且程序相对会简化一些，毕竟在职务级别上并没有实质性改变，只不过享受高一级别待遇罢了。
实职副科，也就是乡科级副职，算是公务员领导职务序列中最低的一个级别，但就是这个最低的级别，也不是每个公务员都能够顺顺利利实现的。对于县区和乡镇工作的人员尤其如此。尽管副科和科员只差三年，但是对于基层公务员来说，很可能这三年代表着一辈子。大多数基层公务员干到退休能实现副科梦就算烧高香了，所以副科就是很多底层公务员的梦想，职级晋升一定程度上缓解了这一困境。
不管是公务员还是事业单位工作人员，从科员或者管理九级岗提拔到副科，任职年限是最基本的要求。按照相关规定，公务员试用期1年之后，需要工作满3年才能达到提拔副科的基本条件，事业单位管理岗同样如此。按照这个时间年限计算，公务员从入职到副科，理论上需要四年，即1年试用期+3年科员任职要求。
满足最基本的任职年限以后，进入提拔实职副科的环节，至于需要哪些组织程序，关键得看这个实职副科的干部管理权限。不同层级的实职副科，程序会大不相同。
如果是县区和乡镇级别的副科，因为是县（区）管干部，其干部管理权限在县委组织部，单位无权提拔。这就需要经过一定的组织程序，完成规定步骤，才能到位。大致流程如下：
1.酝酿环节。由单位主要领导向县委推荐，或者由县领导向县委推荐。
2.制定方案。县委组织部负责制定方案，限定考核条件。
3.组织考核。组织部派出工作组到单位组织民主测评，并向县委组织部报告测评推荐情况，确定考察推荐对象人选。
4.确定对象。县委组织部召开部务会研究，根据各考核组情况汇报，确定初步名单人选。
5.初步讨论。县委五人小组开会，县委组织部长向小组报告干部考核情况和人员初步名单供小组讨论，形成初步的统一意见上县委常委会研究通过。
6.研究通过。县委常委会研究五人小组通过的初步名单，并研究确定人员任职岗位，而后按照程序进行七天公示。
7.下达任命。公示期过后，未发现信访上访告状等问题的，县委组织部拟定文件下发，干部就可以走马上任。
如果是市直机关事业单位，一般情况下副科级干部的管理权限在单位党委（党组），只要单位有空缺，单位党委（党组）决定启动干部提拔工作，经过前期的酝酿磨合，由单位组织人事部门拟制干部提拔晋升方案，报请市委组织部门或者宣传部门党委同意（文化宣传系统干部提拔工作一般归口宣传部门管理）后，单位人事部门按照相应程序做完工作，并进行公示后报上级组织或者宣传部门备案。
如果是省直以上机关单位，副科级干部也是归口单位党委（党组）管理。只不过，省直以上机关的副科级干部，就是四级或者三级主任科员，而且主任科员的数量是没有限制的。这就意味着，在省直以上机关里，一级主任科员以下的职级，只要个人没犯错误，年度考核结果称职以上等次，2年晋一级算是常规操作。通常，厅直机关在党组会上研究通过后，人事部门直接走程序，公示后报备组织部门即可。
参公事业单位和行政机关差别不是很大，在干部提拔任用程序上和公务员基本一致。而事业单位的副科级干部，也就是管理八级岗以上干部的选拔任用，按照各省出台的《市级以下事业单位领导人员管理办法》执行，在任用程序上没有太大区别。
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