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常见的离子片段

正模式

原因

M+1

[M+H]+

M+14

在LCMS中羧酸与甲醇成酯，或其他多一个碳的情况

M+18

[M+NH4]+

M+19

水合

M+23

[M+Na]+

M+33

[M+CH3OH+H]+

M+39

[M+K]+

M+42

[M+CH3CN+H]+

M+64

[M+CH3CN+Na]+

2M+1

二聚+氢离子，倍峰

2M+23

二聚+钠离子

一系列相差42的峰

可能为石蜡油污染

一系列相差44的峰

可能为聚乙二醇污染

M-16

[M-NH2]+(多见于苄胺，烯丙胺，苯甲酰胺）

M-17

[M-OH]+(多见于苄醇，烯丙醇，苯甲酸）

M-31

[M-OCH3]+(多见于苯甲酸甲酯）

M-35

[M-Cl]+(多见于苄氯或烯丙基氯）

M-44

羧酸和含Cbz的分子常见，重排后脱CO2

M-45

[M-OCH2CH3]+(多见于苯甲酸乙酯）

M+1-56

含Boc的分子常见，脱叔丁基片段

M-79

[M-Br]+(多见于苄溴或烯丙基溴）

M+1-100

含Boc的分子常见，脱Boc片段

M-127

[M-I]+(多见于苄碘或烯丙基碘）

(M+2)/2

分子络合两个氢离子，半峰

负模式

原因

M-1

[M-H]-

M+X

[M+X]-, X=溶剂或缓冲溶液的阴离子

M+S-1

[M+S-H]-, S=溶剂

LCMS监测分子量时，苄位的氨基，羟基，卤原子都很容易打断，分子量出苄基正离子的分子量，因为苄基正离子的分子量和消除生成烯烃的分子量正模式M+H的值是一样的，不要误判为产物消除成了烯烃，可以通过核磁进一步表征。 另外苯甲酸和苯甲酸酯，也会出打断羟基和烷氧基后的正离子的分子量。

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烯丙位取代的化合物和苄基的结构类似，因此也有类似现象，在分析此类化合物的质谱时，要留意。

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在分析LCMS图谱时，通常一个特定峰的离子流图谱中，不止一种片段峰，我们在分析时可以相互印证，帮助我们判断反应是否成功。比如我们在做Boc保护的反应【】时，分析其LCMS图谱，看到出原料分子量[M+1]+的峰，我们不要武断的认为其就是原料，要仔细分析这个峰对应的MS图谱中是否有[M+100+1]+或[M+100+Na]+的很小的碎片峰， 只要有一点非常微小的片段，那大概率这个峰应该是上Boc后的产物峰而不是原料。