本文系第三方视角下的学术数据比对复盘,内容源自PubPeer及eScan系统扫描结果,旨在探讨数据规范性

2012年3月,上海交通大学医学院W-L Zhao团队在Cell Death & Disease(IF: 9.0) 发表论文《Therapeutic metformin/AMPK activation blocked lymphoma cell growth via inhibition of mTOR pathway and induction of autophagy》。该研究探讨了二甲双胍通过激活AMPK途径抑制淋巴瘤细胞生长的机制。

近期,相关学术平台 (PubPeer) 反馈该文存在多处数据规范性异常。主要涉及Figure 1、Figure 2、Figure 3、Figure 5与Figure 6之间的Western Blot图像重复、跨实验组复用及图像几何变换(拉伸/翻转)

文章状态为存疑中 (Questioned)。通讯作者方已回应,声称相关图像虽相似但为“不同的条带”,强调这是由于信号通路上下游蛋白的“变化趋势相似”所致。

 一、 论文档案
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一、 论文档案

论文标题:

Therapeutic metformin/AMPK activation blocked lymphoma cell growth via inhibition of mTOR pathway and induction of autophagy

发表期刊:Cell Death & Disease

作者信息 (引用自公开出版物):

W-Y Shi, D Xiao, L Wang, L-H Dong, Z-X Yan, Z-X Shen, S-J Chen, Y Chen, W-L Zhao (通讯作者)

所属机构:上海交通大学医学院 (Shanghai Jiao Tong University School of Medicine)

DOI (公开索引):10.1038/cddis.2012.13

期刊标记:[暂无撤稿/勘误标记]

二、 eScan数据复盘

发表时间:2012年3月。

异常坐标:Figure 1, Figure 2c, Figure 3A/D/E, Figure 5c, Figure 6c。

比对结果:

经PubPeer用户 (如Condylocarpon amazonicum, Sholto David) 标记及eScan特征核对,上述区域在不同细胞系 (Daudi vs Jurkat) 及不同实验条件下显示出高度图像相似性。部分图像涉及水平翻转、垂直拉伸及对比度调整。作者方回应称这些均为独立实验结果。

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三、 异常特征分析 (基于素材标记) 【一】Figure 3内部图像复用与形变

素材标记内容:

据PubPeer用户Sholto David (借助ImageTwin) 及Condylocarpon amazonicum标记显示:

  1. Figure 3A(Jurkat, GAPDH) 与Figure 3D(Jurkat, GAPDH) 的条带形态高度相似。

  2. 标记指出,Figure 3A的图像经拉伸 (stretch) 和旋转 (rotation)处理后,与Figure 3D的图像特征重合。

相关方回应/观点 (引用):

W-Y Shi针对早期质疑回应称:“The GAPDH bands are similar,but they represent two distinct bands. (GAPDH条带相似,但它们代表两个不同的条带。)”

【二】Figure 2与Figure 3跨图复用

素材标记内容:

据PubPeer用户Sholto David标记显示,Figure 2c中的GAPDH条带 (Jurkat组) 与Figure 3e中的GAPDH条带 (Jurkat/AKT组) 存在重复。蓝色框选区域显示两处图像在纹理和噪点模式上一致。

相关方回应/观点 (引用):

W-Y Shi回应称:“These are all different bands. (这些都是不同的条带。)”

【三】Figure 5与Figure 2的跨实验拼接

素材标记内容:

据PubPeer用户Condylocarpon amazonicum标记显示:

  1. Figure 5c中,Daudi细胞系的GAPDH对照与Jurkat细胞系的GAPDH对照实际上是同一张图片 (橙色框所示)。

  2. Figure 5c的GAPDH图像经色阶调整 (Levels Adjusted)垂直压缩/拉伸 (Vertically unstretched)后,与Figure 2c的GAPDH图像相匹配。

  3. 质疑者指出二甲双胍 (Metformin) 似乎具有“将Daudi对照转换为Jurkat对照”的非生物学效应。

相关方回应/观点 (引用):

W-Y Shi回应称:“These are all different bands. (这些都是不同的条带。)”

四、 作者方动态

截至发稿前,上海交通大学医学院作者团队 (W-Y Shi等) 在PubPeer对质疑进行了多轮回复。

核心声明:

作者否认图像造假,坚称:“In the tissue microarray images, p-mTOR and p-4EBP1 are upstream and downstream components of the same signaling pathway. Since phosphorylated proteins are highly sensitive, they exhibit a similar trend of variation. (在组织微阵列图像中,p-mTOR和p-4EBP1是同一信号通路的上游和下游成分。由于磷酸化蛋白高度敏感,它们表现出相似的变化趋势。)” 并在针对WB条带重复的质疑中反复强调:“These are all different bands. (这些都是不同的条带。)”

第三方反驳:

PubPeer用户Condylocarpon amazonicum反驳道:“Trending together is not the same as being identical... Let me repeat myself, these two arrays are identical. (趋势相同不等于完全一致……让我重复一遍,这两个阵列是完全一样的。)”

五、 eScan规范指南

风险提示:

“多张对照组图片(Loading Control)在不同细胞系间出现高度相似,且作者解释(生物学趋势一致)与图像像素级雷同(物理特征一致)存在逻辑冲突”

规范建议一:

建立严格的原始数据归档机制。对于Western Blot实验,必须保留包含分子量标记 (Marker) 的全膜原始扫描件,而非仅保留裁剪后的条带。

规范建议二:

在处理多组实验数据时,严禁混用Loading Control (内参)。不同细胞系、不同处理时间的内参图片必须独立曝光,不得为了排版美观进行拉伸或非线性编辑。

规范建议三:

投稿前建议使用专业工具 (如ImageTwin, Proofig) 对手稿图片进行自查,规避因文件命名混乱导致的“无意混淆”风险。