马光军，原名马辉堂。1917年5月生于湖北省阳新县白沙镇高椅村。
1930年5月，马光军参加红军，因为年龄小，被安排到鄂东南红军医院半工半读。6月16日，成为第一批红三军团战士，后任湘鄂赣军区鄂东南后方红军医院第五所医务班班长、西北分区医务所副所长、西南分区卫生队队长。1932年5月，马光军加入中国共产主义青年团。1936年5月转入中国共产党。马光军参加中央苏区第一至第五次反“围剿”作战和湘鄂赣边区三年游击战争。1934年10月红三军团长征时，马光军奉命留下坚持斗争，他与医院的战友们化整为零，深入通山雁厦山一带打游击，与敌军周旋。天作被，地作床，野菜野果当干粮。马光军后来回忆说，“每天还要四处挖草药，找盐和漂白粉，给受伤的战士们治伤”，坚持了5年时光。
全民族抗日战争爆发后，马光军随湘鄂赣边区红军游击队改编为新四军第一支队一团，任团卫生队军医。参加了铜（陵）繁（昌）保卫战和泾县父子岭战斗。1941年1月皖南事变中，马光军和医疗队战友随部队一起往外冲，准备接应伤员。刚开始打得很顺，医疗队还消灭了几拨敌人，缴枪一百多支。当打到安徽省泾县茂林镇的一个山沟里时，战斗很艰苦，打了几天，子弹打光了，口粮吃完了，组织了多次突围，均未成功。这时，上面命令分散突围，尽量保存实力。有着丰富游击战经验的马光军，带着四五个战友，最终突围成功。新四军重建军部整编部队后，马光军任新四军第七师皖南支队卫生队队长，第七师卫生部保健科副科长、直属所所长，第七师十九旅五十五团卫生队队长，第七师二十一旅卫生部部长，第七师二十旅卫生部副部长。
抗日战争胜利后，马光军入华东军区卫生部干训队学习，后任华东野战军第九纵队卫生部医务主任，华东军区卫生部第三医院院长。参加了胶济线、潍县、济南、淮海、渡江等战役战斗。
新中国成立后，马光军任苏南军区卫生部部长、后勤部部长，华东军区卫生部干部处处长，南京军区后勤司令部检查处处长。1962年3月，任南京军区后勤部财务部部长，南京军区后勤部副政委。“文革”中，马光军曾参加“三支两军”工作，任江苏省南京市红卫区(今建邺区）军宣队负责人，江苏省革命委员会政法组副组长。1978年4月，马光军任南京军区后勤部顾问。
1955年，马光军被授予上校军衔。1964年晋升大校。荣获二级八一勋章、二级独立自由勋章、二级解放勋章和二级红星功勋荣誉章。
1982年，马光军离职休养。
2012年4月16日，马光军在南京逝世，享年95岁。（赵连军根据童来喜、顾永俊、刘华领主编《无衔将领——从新四军中走出来的未授将衔的军以上干部》改编）
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