转自:安必平

探讨PDGFRA获得/扩增在2-4级的成人胶质瘤当中可作为等级提高评估指标。研究中山大学肿瘤防治中心(SYSUCC)胶质瘤病例,应用FISH技术检测PDGFRA基因扩增状态。其中4级胶质母细胞瘤有更高的PDGFRA获得/扩增比例,PDGFRA获得/扩增与患者年龄,疾病分级,其他分子状态相关;发生PDGFRA获得/扩增的2-4级胶质瘤当中预后不良,可作为疾病等级提高指标。

以上文章由中山大学肿瘤防治中心胡婉明教授和李月教授等人与广州安必平医药科技股份有限公司合作,发表于Journal of Neuropathology & Experimental Neurology杂志。

研究方法

该研究入组2225例成人弥漫型胶质瘤,其中321例FISH结果来源中山大学肿瘤防治中心(SYSUCC),1062例NGS结果来源于癌症基因组图谱(TCGA)和872例NGS结果来源于cBioPortal数据库。

入组病例分别进行免疫组化检测、一代测序检测IDH1/2和pTERT基因突变以及FISH检测;其中FISH PDGFRA基因扩增阈值为拷贝数大于5.0且红绿比值>2.0,PDGFRA基因获得阈值为拷贝数大于5.0且红绿比值≤2.0。

研究结果

在入组病例中,4级的胶质瘤病例PDGFRA基因获得/扩增阳性率显著高于2-3级胶质瘤病例;在三组病例数据中,并未发现PDGFRA基因获得/扩增与IDH基因突变状态相关。

通过数据分析,PDGFRA基因获得/扩增与病例发病年龄,高级别的WHO分级以及其他重要分子异常相关(IDH基因野生型、1p19q基因完整、pTERT基因野生型、EGFR基因扩增以及7/10号染色体异常)。

在所有病例当中,发生PDGFRA扩增的患者对比阴性患者预后不良;在WHO 4级的胶质瘤病例中,没有明显的预后影响。在IDH野生型低级别胶质瘤(LGGs)病例中,发生PDGFRA扩增的患者对比阴性患者预后不良。

根据最新的第五版WHO分类,IDH野生型LGGs被重新分类为“胶质母细胞瘤(GBMs),IDH野生型,WHO 4级”;而且需要判断是否发生EGFR扩增、7号/10号染色体异常,以及pTERT基因突变的三种分子异常,但在胶质瘤常见的PDGFRA基因获得/扩增并未包含在分类当中,在文献和本次研究当中的阳性率较高,在文献中为8.5%-29.0%,SYSUCC病例数据中分别为18.38%(GBMs) 和7.57%(LGGs)。因此针对PDGFRA基因获得/扩增在胶质瘤当中的病理诊断应用仍需多予重视。

在本研究中分析2255例胶质瘤病例,发现PDGFRA基因获得/扩增是预测胶质瘤OS的重要影响因素。PDGFRA基因获得/扩增与2-4级胶质瘤患者预后不良密切相关,同时还与IDH野生型LGGs患者预后不良相关。PDGFRA扩增的IDH野生型LGGs对比IDH野生型GBMs预后更差。

因此针对上述结论,研究提出了重要观点,PDGFRA基因获得/扩增可作为一项新的疾病进展指标,伴PDGFRA基因获得/扩增的IDH野生型低级别胶质瘤应诊断为胶质母细胞瘤,IDH野生型,WHO 4级。

在本研究中,PDGFRA获得/扩增与IDH突变型LGGs患者预后无关且阳性率为5.15%,远低于Yang等人在2020年的研究;考虑是FISH检测应用的判读标准以及入组规模的影响。

除SYSUCC的病例外,本研究中的两大入组数据库均使用NGS平台检测PDGFRA扩增。对比NGS平台,FISH可结合组织学形态直接获取肿瘤细胞基因扩增的热点区域,NGS平台通过DNA提取混合了基因扩增细胞与阴性细胞,往往会导致有效基因拷贝数平均值降低,这也解释了对比两大数据库,SYSUCC病例PDGFRA扩增阳性率更高的原因。

2022年Higa等人应用基于扩增子的胶质瘤定制NGS panel,检测PDGFRA扩增阳性率(29.0%)显著高于本研究,并发现PDGFRA扩增与IDH野生型胶质母细胞瘤预后不良相关;但根据本研究数据,PDGFRA扩增与已诊断为4级胶质母细胞瘤的患者OS无关联性,提示PDGFRA扩增在对比GBMs,在LGGs有更突出的应用潜力。

总的来说,全基因组测序在纯肿瘤细胞中检测扩增有高灵敏性,但由于其检测价格昂贵和对DNA样本水平要求较高,往往限制了其应用。 Fujimoto等人应用多重连接依赖性探针扩增(MLPA)技术检测PDGFRA拷贝数增多并揭示IDH野生型LGGs伴PDGFRA扩增有预后不良提示作用,但MLPA技术需要专业软件和正常检测限样本;在本研究中应用FISH检测,对比其他平台,有不受非肿瘤细胞干扰,科室易于开展,高重现性和高性价比等特点。

文献全文

Li Y, Shen X, Zhang J, Xian X, Chen S, Zeng J, Hu W. Adult diffuse IDH-wildtype lower-grade gliomas with PDGFRA gain/amplification should be upgraded as glioblastoma. J Neuropathol Exp Neurol. 2025 Jul 1;84(7):634-641. doi: 10.1093/jnen/nlaf039. PMID: 40238212.

(转自:安必平)

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