雍正元年秋，和硕特部亲王罗卜藏丹津在青海举兵反清。罗卜藏丹津为固始汗之孙，以“复先人霸业”为号召，联合部分宗教上层势力发动叛乱，二十余万蒙藏牧民卷入其中，叛军自柴达木东进，兵锋直指西宁。清廷随即任命陕甘总督年羹尧、四川提督岳钟琪率军平叛，经一年零一个月的征战，叛乱最终平息。叛乱平定后，清廷对叛乱人员，实施了一系列处置。
叛乱爆发后，塔尔寺等部分藏传佛教寺院上层僧侣给予支持，扩大了叛乱声势。清廷迅速调兵遣将，年羹尧、岳钟琪率领清军分路进剿，在青海各地与叛军展开激战。清军先后收复西宁周边要地，击溃叛军主力，至雍正二年秋，叛乱基本平定，大量叛乱人员被剿杀或俘获，仅少数核心人物逃脱。
对于战场上被剿杀的普通叛众，史料记载有数万之众。而对于被俘及主动归降的普通蒙藏牧民，清廷采取了宽宥政策，允许其返回原籍，恢复生产生活。地方官府与部落首领配合，对归降牧民进行登记造册，纳入日常管理体系，未对其实施额外惩罚。
吹喇克诺木齐、阿喇布坦鄂木布、藏巴札木等直接领兵作乱的核心头目，在叛乱中承担指挥与煽动职责，被清军俘获后，经年羹尧等前线统帅初步审讯，核实叛乱事实与具体罪行后，均被公开处以斩决之刑。
此次叛乱中，二十余名已接受清廷册封的蒙古王公卷入其中，包括辅国公、贝子、贝勒、台吉等爵位持有者。清廷对这部分人员进行了专门审讯，核实其叛乱情节后，采取了两类处置方式：部分人员被判处斩决；另一部分人员被“革爵为民”，褫夺清廷赐予的所有爵位、品级及附属特权，贬为庶民。
罗卜藏丹津的母亲与妹夫在叛乱中被清军俘获，并未在地方进行审讯处置，而是被解送北京，交由中央刑部审理。审讯过程由刑部主导，最终判决结果未详细载入公开史料，但处置程序符合清朝中央司法机关审理重大案件的规范。
另一名重要头目诺尔布被俘后，处置分为两步：第一步是“送京讯明”，由中央相关机构审讯查明全部罪状；第二步是“解宁正法”，押解回西北事发地执行死刑。整个过程有明确的流程记录，体现了中央与地方在司法执行中的配合。
叛乱失败后，罗卜藏丹津未被清军俘获，率少数亲信逃亡至新疆，投靠准噶尔部。此后三十余年，罗卜藏丹津一直滞留准噶尔，成为清廷与准噶尔部关系中的重要议题。乾隆二十年，清军趁准噶尔部内乱发动西征，平定准噶尔部后，俘获了逃亡多年的罗卜藏丹津。
罗卜藏丹津被俘后，被押解至北京。乾隆皇帝最终决定免其死罪，相关决策记录于《清高宗实录》中，未对其实施进一步刑罚，其后续生活状况无详细史料记载，但赦免结果明确无误。
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