人体免疫系统具有高度的多样性，其中大部分差异源于非遗传因素。肠道微生物群对免疫系统有着至关重要的影响；然而，其与健康人体基本免疫状态之间的关系仍不完全清楚。
2026年3月9日，加利福尼亚大学旧金山分校Matthew H. Spitzer团队在Cell在线发表题为“Immune-microbiome coordination defines interferon setpoints in healthy humans”的研究论文，该研究通过“免疫微生物组”研究对 110 名健康参与者进行了多组学分析。
基于因素的整合方法发现了协调变化，结果表明干扰素反应是健康参与者中最具变异性的一种免疫特征。微生物群组成、通路和粪便代谢物会与干扰素反应通路同时发生变化。跨越超过一年的纵向数据表明，这些参数在个体之间随着时间的推移具有显著的稳定性。总之，该研究提供了大量数据，用于研究健康个体在稳定状态下免疫状态与微生物群之间的关系，这为阐明与疾病易感性和对治疗的反应相关的个体间差异铺平了道路。
个体间的免疫差异对人类健康和疾病有着广泛的影响。相关人群研究已经开始探寻免疫差异的驱动因素，结果表明环境因素可能比遗传因素的影响更大。更深入的理解可能会为疾病易感性、严重程度以及对免疫调节疗法（包括疫苗接种、癌症免疫疗法以及自身免疫性疾病免疫抑制治疗）的反应性变化提供见解。
肠道微生物群能够影响免疫反应。在癌症患者中，微生物群的特征与临床结果以及检查点抑制剂免疫疗法的效果相关联。在自身免疫性疾病中，微生物群以及共生微生物产生的代谢物会影响治疗反应。在疫苗接种中，微生物群可以作为佐剂，增强免疫原性。这些研究表明，微生物群及其产生的分子可能塑造患者的基线免疫状态，并影响对治疗的免疫反应。动物模型已经揭示了微生物群与免疫细胞发育和活动之间的因果关系。然而，健康人体在稳定状态下微生物群特征与免疫状态的差异之间的关系仍不完全清楚。
一个例子是对于基线或持续性干扰素（IFN）信号传导的调控。这可以从缺乏微生物组的小鼠中 IFN 刺激基因（ISGs）表达的降低以及抗病毒免疫反应的受损中得到证明。实际上，在体内平衡状态下，IFN 的产生量较低，而对 IFN 的感知会导致持续的信号传导，这对于抗菌免疫反应以及塑造免疫环境和免疫活动至关重要。至于这种 IFN 信号在健康人类中的变化情况，以及它是否与人类肠道微生物组有关，目前仍不完全清楚。
文章模式图（图源自Cell）
该研究对健康个体之间的免疫学差异进行了研究，并探究了微生物组特征是否与这些免疫状态有关。该研究生成了免疫系统、微生物组和代谢组的多模态数据，作为该领域的研究资源。该研究采用基于因子的整合分析来捕捉队列中相互变化的特征，并在健康个体中确定了两个主要的免疫变异性轴，涉及 IFN 反应程序。其中一个轴与肠道微生物组特征相关，而另一个则独立于前者。
与变异相关的微生物组轴特别捕捉到了 IFN 反应基因表达以及 SIGLEC-1high表达单核细胞、激活的记忆 T 细胞亚群、激活的 CD69high表达自然杀伤（NK）细胞和黏膜相关不变 T（MAIT）细胞的丰度和表型的差异。将这些特征应用于公共数据集表明，与微生物组相关的 IFN 特征与增强的疫苗反应以及治疗相关的癌症免疫治疗反应有关。此外，这些特征在同一个人身上会随着时间的推移保持稳定，这有助于我们更好地理解健康人体内的免疫系统和微生物组的设定值。
参考消息：
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(26)00168-6
热门跟贴