马奎斯从一号弯的慢速摔车中反弹，在匈牙利站排位赛中击败预选赛热门阿科斯塔，拿下杆位。

排位赛Q2开始后，阿科斯塔延续了周五以来的良好状态，率先做出1分37秒419的成绩上升至头名，紧接着在下一圈飞驰中将成绩提升了两成。与此同时，杜卡迪阵营遭遇早期挫折——马奎斯和迪詹南托尼奥在几秒内先后在一号弯摔车。但两位车手都重新骑上赛车并保持引擎运转，马奎斯迅速升至第二位，力压Trackhouse车队的费尔南德斯。

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比赛还剩最后五分钟时，车手们换上新的软胎重返赛道。阿科斯塔跑出全场首个低于1分37秒的单圈，将与身后车手的差距拉大到半秒以上。但马奎斯随后跑出1分36秒791的成绩，从阿科斯塔手中抢下头名。阿科斯塔在下一圈飞驰中只能做出1分36秒838，让马奎斯锁定杆位——后者随后进一步将成绩提升至1分36秒838，巩固领先优势。这也是马奎斯自赫雷斯的西班牙大奖赛以来，本季拿下的又一个杆位。

格雷西尼车队的阿尔德格尔排在阿科斯塔身后，占据头排发车位。迪詹南托尼奥获得第四，厂队车手巴尼亚亚从Q1一路闯关后排在第五，杜卡迪阵营包揽前五中的四席。阿普利亚阵营表现平平，贝泽奇以落后半秒以上的成绩排在第六，身后是Trackhouse的费尔南德斯和队友马丁。本田车手马里尼从Q1晋级后，排名甚至超过了Trackhouse的另一台赛车——小椋蓝。前十二名由LCR新秀莫雷拉和Pramac车手米勒占据。米尔最初在排位赛中领跑，但被队友马里尼挤出Q2晋级圈，最终只能排在第13位发车，身旁是Tech3的巴斯蒂亚尼尼和雅马哈厂队车手夸塔拉罗。