RNA剪接(RNA splicing)是真核生物基因表达过程中不可或缺的步骤,而承担这一过程的剪接体(spliceosome)则是由多个小核核糖核蛋白(snRNP)动态组装形成的精密分子机器【1-3】。其中,U5 snRNP是剪接催化中心的重要组成部分,其成熟装配过程受到严格调控【4, 5】。然而,U5 snRNP如何由装配中间体进一步成熟,一直是RNA剪接领域尚未完全解决的问题。
近日,复旦大学张端午团队在Nucleic Acids Research发表题为Neurochondrin promotes U5 snRNP maturation by regulating AAR2 release from PRPF8 的研究论文。该研究鉴定了Neurochondrin(NCDN)这一新的U5 snRNP装配调控因子,揭示其通过促进装配伴侣蛋白AAR2从PRPF8上的释放,驱动U5 snRNP成熟;NCDN缺失则导致RNA剪接异常,并抑制胶质瘤细胞生长,为理解剪接体装配机制及剪接相关疾病提供了新的理论依据。
寻找U5 snRNP成熟的关键调控因子
近年来,R2TP复合物、ZNHIT2和ECD等多个装配因子的发现不断完善了U5 snRNP生物发生模型,但PRPF8–AAR2装配中间体如何继续向成熟U5 snRNP转变,其分子机制仍不清楚。
研究团队首先利用蛋白质组学和生化分析系统解析NCDN相互作用网络,发现NCDN与PRPF8、EFTUD2、AAR2等多个U5 snRNP核心组分稳定结合,并能够直接结合装配伴侣AAR2。进一步研究表明,NCDN主要定位于细胞质,与U5 snRNP早期装配过程相吻合,提示其可能参与U5 snRNP生物发生。
NCDN促进AAR2释放,驱动U5 snRNP成熟
机制研究进一步揭示了NCDN在U5 snRNP成熟中的关键作用。作者发现,敲低NCDN后,成熟U5 snRNP及后续U4/U6·U5 tri-snRNP复合物明显减少,而PRPF8与AAR2之间的结合显著增强,说明装配过程停留在PRPF8–AAR2中间体阶段。相反,提高NCDN表达则促进AAR2从PRPF8上解离,加速成熟U5 snRNP形成。研究据此提出,NCDN并非传统意义上的装配支架,而是通过调控AAR2释放推动U5 snRNP完成成熟,为U5 snRNP装配机制补充了关键一环。
剪接异常连接U5 snRNP装配缺陷与胶质瘤发生
转录组测序进一步显示,NCDN缺失导致广泛的可变剪接异常及基因表达重塑,涉及细胞增殖、凋亡等多条关键生物学通路。相应地,NCDN敲低显著抑制胶质瘤细胞增殖并促进细胞凋亡。临床数据库分析进一步发现,NCDN在胶质瘤组织中高表达,且其高表达与患者较差的总体生存密切相关,提示NCDN可能成为胶质瘤等剪接依赖性肿瘤的潜在干预靶点。
该研究将NCDN与U5 snRNP生物发生联系起来,阐明了其通过促进AAR2从PRPF8释放、推动U5 snRNP成熟的新机制,进一步完善了RNA剪接体装配的理论模型。同时,研究建立了U5 snRNP装配异常、RNA剪接失衡与胶质瘤发生之间的联系,为理解剪接体功能失调相关疾病及开发靶向RNA剪接的新型治疗策略提供了新的思路。
复旦大学生物医学研究院任婷蓉博士为论文第一作者,张端午研究员为通讯作者。
原文链接:https://academic.oup.com/nar/article/54/13/gkag685/8725954
制版人:十一
参考文献
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(*排名不分先后)
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