超声发现胎儿结构异常时,传统流程通常建议“先做染色体微阵列(CMA),若结果为阴性,再进行全外显子组测序(WES)”,但这一流程耗时长、费用高,许多孕妇家庭往往难以等待,是临床工作中常见的难题。
近日,广东省妇幼保健院医学遗传中心在《Clinical and Translational Medicine》发表研究,并与2024年发表于《Journal of Translational Medicine》的研究形成系列。该系列研究历时三年,基于近6000个家系的数据,为这一难题提供了新的解决思路:一次WES检测,即可同时给出基因组病和单基因病的“两份答案”。
研究回顾
奠基篇(2024):
“外显子测序看CNV,到底准不准?”
2024年研究回顾性分析2018至2021年共2,428个家系,检出171个临床相关CNV。核心数据:WES检出的大片段CNV(缺失>100 kb / 重复>500 kb)经CMA/MLPA等方法验证,阳性预测值(PPV)达100%;小片段CNV验证一致率分别为缺失81.08%、重复73.91%。
亮点:这是系列研究的第一步:先证明WES看CNV,靠得住。
文章出处:doi:10.1186/s12967-024-05468-1.
最新突破
升级篇:
“WES能否一步到位、替代序贯检测?”
今年发表的新研究将问题推进到临床最关心的环节:不先做CMA,直接用WES当一线检测,行不行?研究对3,426个家系开展WES与CMA平行检测,结论分四点:
高度一致:对致病/疑似致病CNV,WES与CMA一致率达97.03%(嵌合体 95.83%、纯合区域 93.22%);
首创质控体系:基于STD、NEDDI两项指标建立二次方程判定边界——大片段CNV质控敏感性96.6%、小CNV质控敏感性96.2%,且在不同捕获试剂盒和测序平台间可迁移;
看得更细:在3,274例CMA阴性病例中,WES额外检出18个具有临床意义的小CNV(最小仅111bp),包括SMN1 外显子缺失、DMD 重复、NPHP1 纯合缺失等,总体PPV达98.65%;
更省更快:初步测算,一站式WES较"CMA+WES"序贯流程费用降低约30%,诊断周期由6–8周缩短至约3周;三人家系分析使72.58%的意义未明CNV明确了来源。
文章出处:https://doi.org/10.1002/ctm2.70761
一脉相承
三年两步走:
“从方法学验证到临床路径革新”
第一步(2024年)
回答“可信”问题——“准不准”(WES检出CNV后验证可靠性如何);
第二步(2026年)
解决“可用”问题——“能不能一次到位”(以标准化质控框架支撑WES作为产前一线检测,同时完成CNV+SNV联合分析,一次检测覆盖基因组病和单基因病)。
两步走构成完整的循证链条:验证可靠性 → 建立质控标准 → 大样本临床验证 → 提出一线替代方案。
研究团队
本研究依托广东省妇幼保健院医学遗传中心完成。
2024年文章第一作者为曾译墨、丁红珂、王兴旺(共一)
2026年新发表文章第一作者为余丽华、胡蓉、王兴旺、刘永初(共一)
尹爱华、张彦为两篇论文的通讯作者
中心介绍
广东省妇幼保健院医学遗传中心是国家首批产前诊断技术培训基地之一,经过多年的发展,目前已形成覆盖遗传学诊断、胎儿医学、宫内治疗、遗传咨询的全链条服务体系。
团队在学科带头人尹爱华教授的带领下,建立了覆盖血清学筛查、细胞遗传、分子遗传、影像诊断的全链条产前诊断体系。团队长期关注单基因疾病的产前诊断难点。2018年,率先在国内开展基于羊水细胞直接RNA测序的尝试;2022年建立胎儿组织特异性基因的功能验证框架;2024年开发基于转分化的罕见病产前诊断平台。
撰稿:余丽华 副主任技师
排版:陈淑琪
审核:张 彦 主任技师/医师
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