紫外测蛋白去除核酸干扰的全套方法 一、先讲原理:核酸为什么会干扰 蛋白在 280 nm 吸收,核酸最大吸收在 260 nm,核酸同时在 280 nm 有明显吸收峰。只要样品里混有 DNA/RNA,A280 读数会虚高,算出的蛋白浓度偏大。核酸浓度越高,误差越严重。 二、方法 1:公式校正法(最常用,不用额外处理样品) 利用核酸与蛋白在 260、280 nm 的吸收系数差异,测 A260、A280 两个数值,代入校正公式直接算出真实蛋白浓度。 经典 Warren 校正公式(适用大多数蛋白样品) 校正后蛋白浓度(mg/mL)= 1.55 × A280 − 0.76 × A260 适用场景:细胞裂解粗提液、菌体破碎上清、含核酸的粗蛋白,操作最简单,样品无损耗。 辅助判断标准 A260/A280 比值可以判断污染程度: 纯蛋白:比值≈0.5~0.6 比值>0.8:核酸污染明显,必须校正 比值>1.5:核酸含量极高,公式校正误差变大,建议先除核酸再测 三、方法 2:物理去除核酸(核酸污染严重时优先用) 公式只能校正轻度污染,核酸很多时校正不准,需要提前分离核酸: 硫酸鱼精蛋白沉淀核酸 鱼精蛋白带正电,结合带负电核酸形成沉淀,高速离心去掉沉淀,上清再测 A280,几乎无核酸干扰。温和不破坏蛋白活性,适合活性蛋白样品。 PEG / 盐沉淀蛋白 高盐或 PEG 沉淀蛋白,核酸留在上清,弃上清重溶蛋白后检测。缺点是低浓度蛋白回收率偏低。 核酸酶降解法 加入 DNase+RNase 室温孵育,彻底降解核酸。注意两点:酶本身是蛋白,后续需要透析 / 纯化去除酶,否则引入外源蛋白干扰定量;有活性蛋白慎用,避免酶解目标蛋白。 层析分离 分子筛、离子交换柱分离蛋白与核酸,彻底分开两种组分,纯度最高,适合后续还要纯化的样品。 四、方法 3:改用其他定量法,从根源避开核酸干扰 如果核酸很难去除,直接放弃 A280 紫外法,换显色定量: Bradford、BCA 只识别蛋白,核酸几乎不产生显色信号,完全不受核酸影响。菌体裂解液、细胞粗提液大量核酸污染时,优先选 BCA。 五、实操避坑要点 测紫外空白必须用样品缓冲液,不能用水,缓冲液成分会影响基线; 样品浓度不能太低,吸光值控制在 0.1~1.0 之间,数值过低会放大比值误差; 校正公式仅适用于常规球蛋白、白蛋白;不含酪氨酸 / 色氨酸的特殊蛋白,不能用 A280,直接换 BCA; 若样品同时含高浓度还原剂、色素,会同时干扰 A260/A280,校正结果失真,建议沉淀去除杂质后再检测。
紫外测蛋白去除核酸干扰的全套方法 一、先讲原理:核酸为什么会干扰 蛋白在 280 nm 吸收,核酸最大吸收在 260 nm,核酸同时在 280 nm 有明显吸收峰。只要样品里混有 DNA/RNA,A280 读数会虚高,算出的蛋白浓度偏大。核酸浓度越高,误差越严重。 二、方法 1:公式校正法(最常用,不用额外处理样品) 利用核酸与蛋白在 260、280 nm 的吸收系数差异,测 A260、A280 两个数值,代入校正公式直接算出真实蛋白浓度。 经典 Warren 校正公式(适用大多数蛋白样品) 校正后蛋白浓度(mg/mL)= 1.55 × A280 − 0.76 × A260 适用场景:细胞裂解粗提液、菌体破碎上清、含核酸的粗蛋白,操作最简单,样品无损耗。 辅助判断标准 A260/A280 比值可以判断污染程度: 纯蛋白:比值≈0.5~0.6 比值>0.8:核酸污染明显,必须校正 比值>1.5:核酸含量极高,公式校正误差变大,建议先除核酸再测 三、方法 2:物理去除核酸(核酸污染严重时优先用) 公式只能校正轻度污染,核酸很多时校正不准,需要提前分离核酸: 硫酸鱼精蛋白沉淀核酸 鱼精蛋白带正电,结合带负电核酸形成沉淀,高速离心去掉沉淀,上清再测 A280,几乎无核酸干扰。温和不破坏蛋白活性,适合活性蛋白样品。 PEG / 盐沉淀蛋白 高盐或 PEG 沉淀蛋白,核酸留在上清,弃上清重溶蛋白后检测。缺点是低浓度蛋白回收率偏低。 核酸酶降解法 加入 DNase+RNase 室温孵育,彻底降解核酸。注意两点:酶本身是蛋白,后续需要透析 / 纯化去除酶,否则引入外源蛋白干扰定量;有活性蛋白慎用,避免酶解目标蛋白。 层析分离 分子筛、离子交换柱分离蛋白与核酸,彻底分开两种组分,纯度最高,适合后续还要纯化的样品。 四、方法 3:改用其他定量法,从根源避开核酸干扰 如果核酸很难去除,直接放弃 A280 紫外法,换显色定量: Bradford、BCA 只识别蛋白,核酸几乎不产生显色信号,完全不受核酸影响。菌体裂解液、细胞粗提液大量核酸污染时,优先选 BCA。 五、实操避坑要点 测紫外空白必须用样品缓冲液,不能用水,缓冲液成分会影响基线; 样品浓度不能太低,吸光值控制在 0.1~1.0 之间,数值过低会放大比值误差; 校正公式仅适用于常规球蛋白、白蛋白;不含酪氨酸 / 色氨酸的特殊蛋白,不能用 A280,直接换 BCA; 若样品同时含高浓度还原剂、色素,会同时干扰 A260/A280,校正结果失真,建议沉淀去除杂质后再检测。

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